SX-Aurora TSUBASAへの OSSアプリケーション移植調査
氏名:片岡洋介
所属:日本電気株式会社 官公ソリューション事業部門
概要:SX-Aurora TSUBASA(SX-AT)のベクトル演算性能の優位性を発揮するアプリケーション移植技術の確立を本研究の目的とする。
今年度はフラグメント分子軌道法計算プログラムABINIT-MPのSX-ATへの移植性調査、技術課題の抽出、ならびに、性能調査を実施した。
また、スカラ型スーパーコンピュータとの性能比較を通じて、ベクトル演算性能の優位性を検証した。
成果として、ABINIT-MPのSX-ATへの移植・性能分析および最適化施策適用により、スカラ型スーパーコンピュータと比較して、新型コロナウイルスのメインプロテアーゼ +N3リガンドの結晶構造 (PDB-ID=6LU7)における 6-31G*基底でのFMO-MP2計算において約1.35倍の性能優位性を実現した。
Posted : 2023年03月31日