Electronic structure calculations of the special pair P740 in photosystem I reaction center of Acaryochloris marina
Authors:Hirotaka Kitoh-Nishioka
Affiliation:Faculty of Science and Engineering, Kindai University
Abstract:アカリオクロリス光化学系Iの結晶構造をもとに、スペシャルペアP740の光誘起電荷分離後の電子状態をQM/MM計算によって求めた。量子化学計算プログラムはORCA の最新ヴァージョン6.0.1を用いた。P740(クロロフィルdとクロロフィルd’の2量体)をQM領域、タンパク質とその他の色素/補因子をMM領域に設定したQM/MM(UB3LYP-D3BJ/def2-TZVP:Amber99)計算を実行し、QM領域の構造最適化後にスピン密度を解析した。その結果、P740カチオンのスピン密度はタンパク質からの静電相互作用の影響によってBブランチ側クロロフィルに偏り、対称性が破られていることが分かった。
Posted : March 31,2025