Structure analysis of amphtoericin B ion channel using NMR

 

Authors:Tomoya Yamamoto

Affiliation:Center of Future innovation, Department of Engineering, Osaka University

Abstract:Amphotericin Bが形成するイオンチャネル構造から得られた固体NMRデータを解釈するために、Gaussianによってイオンチャネル中でのNMRピークをシミュレーションした。計算手法としては共同研究先で得られたMD計算の座標データをもとにGaussianによる量子化学計算ファイルを作成し、分子の配座からNMRピーク形状を推定する。結果として実験結果に依存したピーク線幅の変化を計算によっても再現できた。

 




Posted : March 31,2025