所属：大阪大学サイバーメディアセンター

概要：タンパク質のファネル的エネルギー景観がどれくらい珍しいかを調べ、タンパク質の進化について唆示を得ることを目的として、ランダムネットワーク上のランダムエネルギーモデルがファネル的構造になる確率をマルチカノニカルモンテカルロ法によって計算した。結果として、ファネルの実現確率はネットワークごとに大きく違い、1000ネットワークの分布を取ると概ね対数正規分布になることがわかった。これはタンパク質の言葉でいうと変異に対して頑健な天然構造が少数存在することを意味し、タンパク質のfoldの種類が少ない理由を説明すると考えている。

論文掲載,発表実績:
（国際会議会議録掲載論文）

• Macoto Kikuchi, "Finding Folding Funnels in Random Network" , Dynamic Days Asia Pacific, Hong Kong, China, December 2016

（国内研究会等発表論文）

• 菊池誠, 永田新太郎, "Folding Funnel の珍しさ", 日本物理学会2017年秋の分科会, 金沢大学, 2016年9月
• 菊池誠, "Folding Funnel の珍しさII", 日本物理学会2017年年会, 大阪大学, 2017年3月