本システムでは、プログラムの作成から、作成モジュールの実行までを、HPCフロントエンドまたは占有型フロントエンドで行います。基本的なプログラムの実行までの流れは以下となります。本項では「2. ソースコードから実行モジュールの生成（コンパイル）」の方法について詳細を記述します。

1. ソースコードの作成・編集・修正
2. ソースコードから実行モジュールの生成（コンパイル）
3. 実行モジュールの実行

コンパイラ・MPIの利用

本システムでは、各種のプログラミング言語が利用可能です。プログラミング言語を使うためのコンパイラやMPI、付随するライブラリの環境セットは、ベース環境としてまとめられています。本節ではプログラミング言語ごとのベース環境の概要を記載します。
 

C/C++言語、FORTRAN言語

C/C++言語、FORTRAN言語のプログラム開発に際しては、汎用CPUの各計算環境に適したコンパイラを利用できます。また、スレッド並列、MPI並列による並列実行モジュールの作成も可能です。

ご利用の際は、環境設定に従い、「Environment Modules」を利用して、モジュールを読み込みます。モジュールの中には、各計算環境でプログラム開発を行うのに適した構成を、推奨環境として整備しています。各推奨環境の構成は以下の通りです。

 

計算環境	推奨環境 モジュール名	コンパイラ	MPI
汎用CPU計算環境	BaseCPU	Intel oneAPI	Intel MPI
(なし)	BaseGCC	GNU Compiler	Open MPI

 

その他のプログラミング言語

C/C++言語、FORTRAN言語以外のプログラム言語についても、ベース環境を用意しています。利用可能なプログラミング言語環境は以下の通りです。
 

言語環境	モジュール名	バージョン	説明	備考
Python3	BasePy	3.13.5	Python 言語向け
R	BaseR	4.5.1	R 言語向け
JAVA	BaseJDK	21.0.8	JAVA 言語向け	OpenJDK
Julia	BaseJulia	1.11.6	Julia 言語向け

ライブラリ・言語モジュールの利用

本システムで利用可能なライブラリ群はmoduleコマンドにより環境変数を設定します。
また、各ライブラリのモジュールは<モジュール名>/<バージョン>でバージョン管理されます。ライブラリは、各ベース環境に同梱されています。それらのライブラリはベースモジュールを読み込んだ後に利用可能となります。

利用可能なライブラリ、言語モジュールは以下の通りです。
 

ライブラリ 言語モジュール	モジュール名
	BaseCPU	BaseGCC	BasePy	BaseR
Intel MKL (※)	○	-	-	-
GNU Scientific Library	-	○	-	-
HDF5	○	-	-	-
NetCDF	○	-	-	-
Parallel netcdf	○	-	-	-
Keras	-	-	○	-
PyTorch	-	-	○	-
TensorFlow	-	-	○	-
pbdR	-	-	-	○

※ BLAS, LAPACK, ScaLAPACK は「Intel MKL」に含まれています。