OCTOPUSには以下のGnuplotがインストールされています。

・4.6 (デフォルト)
・5.2.4 (/octfs/apl/Gnuplot/5.2.4)

Octaveから呼び出されるGnuplotのバージョンは、以下の２通りの方法で指定が可能です。
 
・呼び出したいバージョンのパスを設定する

下記のジョブスクリプト例の4行目のように、Octaveの実行の前にGnuplotのバージョンのパスを設定することで、呼び出すバージョンを指定することができます。（Gnuplot5.2.4を呼び出す場合の例です）
パスを設定しない場合、デフォルトのバージョンが呼び出されます。

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#!/bin/bash #PBS -q OCTOPUS #PBS -l elapstim_req=1:00:00 export PATH=/octfs/apl/Gnuplot/5.2.4/bin:$PATH cd $PBS_O_WORKDIR /octfs/apl/Octave/5.1.0/bin/octave-5.1.0 file.m

・Octaveの設定ファイル「.octaverc」を作成する

ホームディレクトリにOctaveの設定ファイル「.octaverc」を作成し、下記の一文を記述してください。

gnuplot_binary="[Gnuplotの実行ファイルのパス]"

上記のように記述することで、Octaveから呼び出されるデフォルトのGnuplotの実行ファイルを設定できます。
例えば、5.2.4を呼び出す場合は「gnuplot_binary="/octfs/apl/Gnuplot/5.2.4/bin"」と記述してください。

Yes, you can use.
If you already use Gaussian, you don't have to apply for Gaussian any more.

[The detail of error]
Attempting to connect to license server
Received license from server
Checking hostid 0
OM(Root) -> X Error of failed request: BadValue (integer parameter out of range for operation)
Major opcode of failed request: 150 (GLX)
Minor opcode of failed request: 3 (X_GLXCreateContext)
Value in failed request: 0x0
Serial number of failed request: 4664
Current serial number in output stream: 4666

 
In the case of this error, please add -nohw option as the following and run AVS/Express with the software renderer mode.

avs -nohw

You can do it also with setting the following environment value.

XP_DEFAULT_RENDERER=SW

Please contact us on the following web form, if you did not avoid this error with this procedure.
contact form

If you install any library and application to your disk, our permits are not necessary.
 
If you expect that center install any library and application to a whole of system, please contact us from the following web form:
Inquiry / Request form
 

Please note that we may not permit or we may ask to install with yourself, depending on the kind of library and application.

No, you can't use. You can use GROMACS on only VCC.
We have not planed to install to SX-ACE. Thank you for your understanding.

Please see the following page.
 
How to use GROMACS

You can use commands written the Users's Reference. Please write this command to the job script file and submit.
Utility Programs

[Example] If "water.chk" on current directory changes "water.fchk", please write following script to the job script file.

${g09root}/g09/formchk water.chk water.fchk