OCTOPUSでは、量子化学計算プログラムGAMESS(v2024.2.1)をご利用いただけます。

利用方法

下記のコマンドで環境設定ファイルを読み込むことで、GAMESSのコマンドが利用可能になります。

$ module load BaseApp
$ module load GAMESS/v2024.2.1

バッチジョブで実行してください。ジョブスクリプト例は下記の通りです。

#!/bin/bash

#PBS -q OCT

#PBS --group=【グループ名】

#PBS -l elapstim_req=01:00:00

#PBS -l cpunum_job=12

#PBS -b 2

#PBS -T intmpi

module load BaseApp

module load GAMESS/v2024.2.1

cd $PBS_O_WORKDIR

export SCR=$PBS_O_WORKDIR # スクラッチディレクトリのパス

export USERSCR=$PBS_O_WORKDIR # スクラッチディレクトリのパス

rungms input.inp 00 24 12

このジョブスクリプトでは24プロセス並列実行（1ノードあたり12プロセス）しています。実行コマンド"rungms"の引数は以下通りです。

input.inp	インプットファイルのファイル名です。
00	GAMESSのバージョンです。"00"で固定してください。
24	総並列プロセス数です。この場合24プロセス並列実行になります。
12	1ノードあたりのプロセス数です。この場合1ノードあたり12プロセス並列になります。

ジョブスクリプトのその他のオプションについてはこちら、ジョブスクリプトの投入方法についてはこちらをご覧ください。

参考情報