公式サイトはこちらをご参照ください。QuantumESPRESSO 6.3をOCTOPUS 汎用CPUノード群向けにインストールしております。また、一部パッケージについてはご利用いただけませんのでご注意ください。
バッチリクエストによる処理のみ許可しております。ジョブスクリプト例と、ジョブ実行方法について以下で解説いたします。
ジョブスクリプトの作成
以下の例は96MPIプロセス(汎用CPUノード群4ノードを使用)で実行する場合のジョブスクリプトです。ファイル名に特に指定はありませんが、本項ではjob.shとしています。
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#!/bin/bash #PBS -q OCTOPUS #PBS -l elapstim_req=1:00:00 #PBS -T intmpi #PBS -b 4 source /octfs/apl/Intel/psxece2019u5/bin/ifortvars.sh intel64 source /octfs/apl/Intel/psxece2019u5/impi/2019.5.281/intel64/bin/mpivars.sh cd $PBS_O_WORKDIR mpirun ${NQSII_MPIOPTS} -np 96 /octfs/apl/QE/6.3/bin/pw.x -in test_1.in |
ジョブスクリプトのその他の行についてはこちらをご参照ください。
実行方法
作成したジョブスクリプトを投入します。
% qsub job.sh
投入したジョブの状況確認方法はこちら。
実行が終了すると、結果ファイルに計算結果が出力されます。
