SQUIDにMPIを独自にインストールして利用することは可能ですか?
OpenMPIについては独自にインストールしてご利用することが可能です。
MPIのパスを記載したmoduleファイルを作成してください。
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#%Module 1.0 # # OMP-sample # proc ModulesHelp { } { puts stderr "OMP-sample\n" } prepend-path PATH /sqfs/work/(MPIインストール先)/bin prepend-path LD_LIBRARY_PATH /sqfs/work/(MPIインストール先)//lib/ setenv MPI_ROOT /sqfs/work/(MPIインストール先)/ |
ジョブスクリプトの中で以下のようにmoduleファイル指定してください。
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#PBS -T openmpi #PBS -v NQSV_MPI_MODULE=moduleファイルへの(フルパス) |