2023年度末メンテナンスに伴う SQUIDのソフトウェア アップデート内容について

SQUID

    以下のとおり、ソフトウェアのアップデートを実施しました。

    汎用CPUノード群 GPUノード群 ベクトルノード群
    コンパイラ Intel one API 2023.0→2023.2 NVIDIA HPC SDK 22.11→23.11 NEC SDK 5.0.0→5.2.0
    通信ライブラリ intelMPI 2021.8.0→2021.10.0 OpenMPI 4.1.4→4.1.5 NEC MPI 3.2.0→3.6.0

    最新環境をご利用いただく場合は、以下のように実行してください。

    module load BaseCPU/2024→汎用CPUノード群向け(Intelコンパイラ)
    module load BaseGCC/2024→汎用CPUノード群向け(GNUコンパイラ)
    module load BaseGPU/2024→GPUノード群向け
    module load BaseVEC/2024→ベクトルノード群向け

    実行時エラーとなる場合、上記環境にて再コンパイルをお願いいたします。
     

    OCTOPUSから移行したデータについて

      2023年度OCTOPUSをご利用中で、2024年度SQUIDの利用申請を実施いただいた方を対象にSQUIDからOCTOPUSへデータ移行を実施しております。

      移行先のディレクトリ(SQUID) /octfs/work
      /octfs/home

      データ移行に伴いusage_viewコマンドにおいて、表示結果の不具合が発生しております。詳細は以下をご参照ください。

      データ移行に伴うusage_viewコマンド表示の不具合について


       

    gccについて

      gcc11をインストール済みです。
      gccのデフォルトバージョンは8.5となっておりますので、
      gcc11をお使いの場合は、以下のようにモジュールロードしてご利用ください。

      $ module load /system/apps/env/gcc/Compiler/gcc/11.4.0

       

    ベクトルノードでのQuantum Espresso利用について

      これまでベクトルノードでのQuantum Espresso利用時は以下のように 「”(ダブルクオート)」で囲み実行いただいておりましたが、「”(ダブルクオート)」が不要になりました。

      mpirun -version /opt/nec/ve/bin/mpisep.sh ${LM} "-np 80 -npool 2 -nband 1 -ntg 1 -ndiag 4 -input ausurf.in"

      mpirun -version /opt/nec/ve/bin/mpisep.sh ${LM} -np 80 -npool 2 -nband 1 -ntg 1 -ndiag 4 -input ausurf.in

       

      QuantumESPRESSO利用方法の詳細については以下を参照ください。

      QuantumESPRESSO利用方法(SQUID)


       

    AVSについて

      Xsever、Xclientのバージョンの相性で起動時にOpenGLのエラーが発生する場合がございます。
      その場合、エラーを解消するためにOpenGLの利用をオフにする「-nohwオプション」を指定いただくようにお願いいたします。
       

    パラメトリックリクエストのサブリクエストについて

      バッチサーバ上で生成されるサブリクエスの上限を100→500に変更いたしました。
       

    GPUのLAMMPSについて

    IDL9.0について

      IDL9.0をご利用いただけるようになりました。
      *従来インストールされていたIDL8.8同時起動可能であることを確認済みです。
       

      IDL9.0をお使いの場合は、以下のようにモジュールロードしてご利用ください。

      $ module load BaseApp/2024
      $ module load IDL/9.0
      $ idlde

       




    Posted : 2024年04月17日