本講習会ではスーパーコンピュータでの計算に必要となる、ジョブスクリプトの投入による計算機利用（バッチ利用）の概要を説明し、サイバーメディアセンターのシステムを利用するためのジョブの投入方法を学びます。講習会の後半では応用テクニックやコンテナ利用など、高度なジョブの投入方法を紹介します。スーパーコンピュータを1週間自由に使える「無料お試しアカウント」付きです。
本講習会では並列プログラミング手法として一般的なOpenMP、MPI、ベクトルプロセッサで利用できる自動並列化機能による並列プログラミングの基礎と利用方法を説明します。スーパーコンピュータを1週間自由に使える「無料お試しアカウント」付きです。
OpenMPとは、プログラム中に"指示行"と呼ばれる記述を追加することでノード内並列化（共有メモリ並列処理）を行う方法です。指示行の挿入のみで並列化が可能なため、プログラミングの負担が少なく移植性が高いという利点があります。ただしノードを跨いだ並列化は行えないため、大規模な並列化を行うにはMPIと組み合わせてプログラミングを行う必要があります。なお、Fortran 言語と C 言語で記述が少し異なります。
MPIとは、分散メモリ並列処理におけるメッセージパッシング(複数のプロセス間でデータをやり取りするために用いるメッセージ通信操作)の標準規格のことです。ノード間をまたがる並列化が可能となるため、その分大きなメモリ空間が利用可能になります。ただし、ユーザ自身で処理の分割やノード間の通信を指示する必要があるため、プログラミングの負担がやや大きくなります。
新型コロナウイルス感染症の影響を鑑み、本講習会はオンライン会議ツールを用いたオンライン配信形式で行います。ネットワークに接続可能な環境をご用意ください。
OpenMP利用方法(SQUID)
MPI利用方法(SQUID)
MPI＋OpenMP利用方法(SQUID)
ベクトルエンジン向けC/C++コンパイラの使い方
ベクトルエンジン向けFortranコンパイラの使い方
並列プログラミング入門 OpenMP・自動並列
並列プログラミング入門 MPI
本講習会ではOpenMPによる一般的な並列プログラミングの基礎とその利用方法を Fortran 言語及び C 言語を用いた実習により説明します。スーパーコンピュータを1週間自由に使える「無料お試しアカウント」付きです。
OpenMPとは、プログラム中に"指示行"と呼ばれる記述を追加することでノード内並列化（共有メモリ並列処理）を行う方法です。指示行の挿入のみで並列化が可能なため、プログラミングの負担が少なく移植性が高いという利点があります。ただしノードを跨いだ並列化は行えないため、大規模な並列化を行うにはMPIと組み合わせてプログラミングを行う必要があります。なお、Fortran 言語と C 言語で記述が少し異なります。
OpenMP利用方法(SQUID)
OpenMP利用方法(OCTOPUS)
本講習会では、並列プログラミングについて、まったくの初心者向けにその手法や考え方の基礎について紹介します。また、大規模な並列計算が可能な大型計算機やコンピュータシステムを扱うのに必要となるUnixについても、まったくの初心者でも困らないように簡単な概観を提示します。こうした並列システム、並列プログラミングについてあまり触れたことはないが興味のある方、その上で学習、研究をしようと考えている方はぜひご参加ください。
本講習会はオンライン会議ツールを用いたオンライン配信形式で行います。ネットワークに接続可能な環境をご用意ください。
職場や研究室でシミュレーションを実施しているが、計算資源が足りない・もっと大規模/高精度のシミュレーションを実施したい・シミュレーションをもっと高速化したいなどの課題を持たれている方に向けて大阪大学サイバーメディアセンターのスーパコンピュータの利用を検討、考えてみたい方に向けた利用説明会です。
説明会では、利用申請の流れや利用者が利用できる支援機能、利用できるシステムの概要や簡単な利用方法などについて説明します。
| 14:00-14:20 | 主旨説明とシステムの概要（サイバーメディアセンター 伊達 進） |
| 14:20-14:40 | 利用申請と利用者支援（サイバーメディアセンター 山下 晃弘） |
| 14:40-15:40 | スパコンの使い方（情報推進部 情報基盤課 技術職員） |
| 15:40-16:00 | 個別相談会（注1） |
注１：個別相談会は前日までに事前予約が必要です。下記、申し込みフォームにて事前申し込みをお願いします。ご要望多数の場合は、開催を調整させていただくことがあります。
本講習会ではサイバーメディアセンターのスーパーコンピュータの基礎的な知識と、その使い方について学びます。大規模計算機システムを１週間自由に使用できる「無料お試しアカウント」を配布しますので、スーパーコンピュータを使った研究を検討している方に、大変おすすめできる内容となっています。
大学や高等専門学校の教員・学生であれば、誰でも受講は可能となっておりますので、お気軽にご参加いただければと思います。
5月23日(月)
13:30 - 14:00 スパコンの概要とCMCのスパコンの紹介
14:00 - 15:30 スパコンの使い方
※備考：セミナー内でプログラミング環境として使用するIDEは、主にGoogle Colaboratoryを使用して進めます。Google Colaboratoryは無料ですが、利用にはGoogleアカウントが必要になります。Google Colaboratoryについてはこちらをご参照ください。また、これまで使い慣れたPythonをサポートしているIDEで参加いただいても質問していただけます。
| 5月20日（金）13:15 - 15:00 | |
|---|---|
| 13:15 - 13:20 | ご挨拶と趣旨説明 大阪大学 サイバーメディアセンター 応用情報システム研究部門 伊達 進 |
| 13:20 - 14:45 | 数値計算、データの可視化、Webスクレイピング等を通じて、Pythonライブラリの使い方を学びます。 （講師：大阪大学 サイバーメディアセンター 応用情報システム研究部門 / 大阪大学大学院情報科学研究科 安田 成寿） |
| 14:45 - 15:00 | ラップアップと質問コーナー |
| 5月27日（金）13:15 - 15:00 | |
|---|---|
| 13:15 - 14:45 | チュートリアル |
| 14:45 - 15:00 | ラップアップと質問コーナー |
| 6月3日（金）13:15 - 15:00 | |
|---|---|
| 13:15 - 14:45 | チュートリアル |
| 14:45 - 15:00 | ラップアップと質問コーナー |
本シンポジウムは終了いたしました。大変多くの方にご出席いただき、大盛況のシンポジウムとなりましたことを心よりお礼申し上げます。
（参加者数：113名）
| 9:30-9:40 | 開会の挨拶 | ||
| 下條 真司 | 大阪大学 サイバーメディアセンター センター長・教授 |
||
| 9:40-10:30 | 基調講演 「データ利活用に向けた仮想化基盤mdx」 |
||
| 塙 敏博 | 東京大学 情報基盤センター スーパーコンピューティング研究部門 教授 |
||
| 10:30-10:50 | 休憩 | ||
| 10:50-11:30 | 「歯科診療におけるビッグデータの蓄積と活用『myDentalAIプロジェクト』」 | ||
| 野崎 一徳 | 大阪大学 歯学部附属病院 医療情報室 / オーラルデータサイエンス共同研究部門 室長・准教授 |
||
| 11:30-12:00 | 「データ集約基盤ONIONの概要と今後の課題」 | ||
| 伊達 進 | 大阪大学 サイバーメディアセンター 応用情報システム研究部門 准教授 |
||
| 12:00-13:00 | 昼食休憩 | ||
| 13:00-13:40 | 招待講演 「理化学研究所のデータ管理システムと連携」 |
||
| 實本 英之 | 理化学研究所 情報統合本部 基盤研究開発部門 データ管理システム開発ユニット ユニットリーダー |
||
| 13:40-14:20 | 招待講演 「国立情報学研究所が提供する研究データ管理サービス」 |
||
| 込山 悠介 | 国立情報学研究所コンテンツ科学研究系 / オープンサイエンス基盤研究センター 副センター長・准教授 |
||
| 14:20-15:00 | 「大阪大学レーザー科学研究所における共同利用・共同研究でのデータ活用と管理」 | ||
| 長友 英夫 | 大阪大学 レーザー科学研究所 理論・計算科学研究部門 准教授 |
||
| 15:00-15:20 | 休憩 | ||
| 15:20-17:00 | パネルディスカッション 「スーパーコンピューティングとデータ管理のあり方」 |
||
| 座長 | 木戸 善之 | 大阪大学 サイバーメディアセンター 応用情報システム研究部門 講師 |
|
| パネリスト | 甲斐 尚人 | 大阪大学 附属図書館 研究開発室 / サイバーメディアセンター 助教 |
|
| 込山 悠介 | 国立情報学研究所 コンテンツ科学研究系 / オープンサイエンス基盤研究センター 副センター長・准教授 |
||
| 實本 英之 | 理化学研究所 情報統合本部 基盤研究開発部門 データ管理システム開発ユニット ユニットリーダー |
||
| 長友 英夫 | 大阪大学 レーザー科学研究所 理論・計算科学研究部門 准教授 |
||
| 並木 悠太 | 大阪大学 サイバーメディアセンター 高性能計算・データ分析融合基盤協働研究所 研究員 / 日本電気株式会社 AIプラットフォーム事業部 エキスパート |
||
| 野崎 一徳 | 大阪大学 歯学部附属病院 医療情報室 / オーラルデータサイエンス共同研究部門 室長・准教授 |
||
| 17:00-17:10 | 閉会の挨拶 | ||
| 降籏 大介 | 大阪大学 サイバーメディアセンター 副センター長・教授 |
||
技術担当：Cyber HPC Symposium テクニカルチーム( cyberhpc-tech@cmc.osaka-u.ac.jp )
サイバーメディアセンターが実施している公募型利用制度によって得られた成果を、研究者の皆様に成果報告会という形でご発表いただきます。大規模計算機システムを活用した研究に興味のある方や、今後の公募型利用制度への応募を検討されている方は、是非ご参加ください。
開催日：2022年3月10日(木)13:30-17:20
会 場：オンライン配信
参加費：無料
日時：2022年3月10日（木）13:30 - 17:20
司会：吉野 元 （大阪大学サイバーメディアセンター 准教授）
| 13:30-13:35 | 開会の挨拶 | |||
| 菊池 誠 | 大阪大学 サイバーメディアセンター 教授 |
|||
| 13:35-14:05 | 「Dirac流モノポール凝縮によるQCDのカラー閉じ込め機構のモンテ・カルロ法研究」 | |||
| 鈴木 恒雄 | 大阪大学 核物理研究センター 協同研究員 |
|||
| 14:05-14:35 | 「素粒子物理学実験への機械学習の適用研究」 | |||
| 岩崎 昌子 | 大阪市立大学 理学研究科 准教授 |
|||
| 14:35-15:05 | 「テンソルネットワークを用いた多体系の統計力学的研究」 | |||
| 大塚 高弘 | 大阪大学 理学研究科 大学院生 |
|||
| 15:05-15:35 | 「画像と深層学習を用いた骨格標本上の形態学的変異の可視化と発見」 | |||
| 森田 尭 | 大阪大学 産業科学研究所 助教 |
|||
| 15:35-15:45 | 休憩 | |||
| 15:45-16:15 | 「ニューラルネットワークによる蛋白質機能予測の解釈性に関する研究」 | |||
| 小山 恭平 | 大阪大学 生命機能研究科 大学院生 |
|||
| 16:15-16:45 | 「Ginzburg-Landau理論に基づいた数値シミュレーションによる 超伝導の磁場依存性の研究」 |
|||
| 兼安 洋乃 （代理発表：大塚 剛生） |
兵庫県立大学 理学研究科 助教 （兵庫県立大学 理学研究科 大学院生） |
|||
| 16:45-17:15 | 「勾配流法とスパースモデリング法によるQCD粘性の決定」 | |||
| 伊藤 悦子 | 理化学研究所 仁科加速器科学研究センター 研究員 |
|||
| 17:15-17:20 | 閉会の挨拶 | |||
| 木戸 善之 | 大阪大学 サイバーメディアセンター 講師 |
|||
※発表25分、質疑5分の予定です。
| 1月20日（木）13:00 - 15:00 | |
|---|---|
| 13:00 - 13:05 | ご挨拶と趣旨説明 大阪大学 サイバーメディアセンター 応用情報システム研究部門 准教授 伊達 進 |
| 13:05 - 13:30 | トレンド：Pythonの利用動向 講師：大阪大学 サイバーメディアセンター 招へい准教授 (筑波大学 システム情報系 准教授) 阿部 洋丈 |
| 13:30 - 13:45 | 座談会（雑談コーナー） サイバーメディアセンターのスパコンを運用している教職員が参加。 当日のプログラムについての意見や、サイバーメディアセンターのスーパコンピュータやその利用について、自由に質問いただけます。例えば、何故、スパコンはタコとイカなのか？ストレージは何故、タマネギなのか？などもokです。 |
| 13:45 - 15:00 | Pythonチュートリアル(1)-#1 環境構築とIDE操作、Pythonプログラミングの初歩までを学習します。プログラムしたファイルの保存や読み出し、実行についても学習します。 講師：大阪大学 サイバーメディアセンター 応用情報システム研究部門 / 大阪大学 大学院情報科学研究科 秋吉 圭輔 |
| 1月27日（木）13:00 - 15:00 | |
|---|---|
| 13:00 - 14:30 | チュートリアル |
| 14:30 - 15:00 | ラップアップと質問コーナー |
| 2月3日（木）13:00 - 15:00 | |
|---|---|
| 13:00 - 14:30 | チュートリアル |
| 14:30 - 15:00 | ラップアップと質問コーナー |
本講習会では、SQUIDやOCTOPUSに導入されているIntelコンパイラの概要、及びIntelコンパイラで利用可能な各種オプションを紹介し、これらを活用したチューニング手法について学びます。スーパーコンピュータを1週間自由に使える「無料お試しアカウント」付きです。
密度汎関数法に基づき、高速・高精度な電子状態計算を行う、汎用第一原理計算プログラムOpenMXの講習会を行います。OpenMXは、一般的な機能に加え、内殻光電子分光(XPS)のスペクトル計算やバンドアンフォールディング法などの実験結果の理論解析が可能な特徴ある機能を数多く有し、結晶界面や表面、溶液など、複雑構造の大規模計算にも多数の適用事例があります。今回の講習会では、OpenMXを用いた大規模な量子化学計算にご興味のある方を対象に、OpenMXの概要と基本的な使い方を、当センターのOCTOPUSを利用して、実際にOpenMXに触れていただきながら講習を行います。特に、初めてOpenMXを実行する民間企業の研究・技術者、実験研究者、大学院生のご参加を歓迎いたします。
| 13:30-14:30 | OpenMXの概要の説明 |
| 14:30-15:00 | OCTOPUSへのログイン、演習環境設定 |
| 15:00-15:20 | ＜休憩＞ |
| 15:20-17:30 | 実習 |
本講習会では、OpenACCによるGPUプログラミングの最適化手法やテクニック、複数GPUでの並列実行方法など、応用的なGPUプログラミングを中心に学びます。
本来はコンピュータの画像や映像の処理を担当する画像処理装置（Graphics Processing Unit）です。CPUと比べて複雑な命令は苦手ですが、単純な演算性能は非常に高いため、画像処理以外も行うGPGPU（General-Purpose GPU）として近年のスーパーコンピュータに搭載されています。GPUで計算を行うには、CUDAやOpenACCによるプログラミングが必要になります。
| 13:30 - 13:50 | Docker を用いたOCTOPUS でのジョブ実行方法 講師：福井大学 工学系部門 情報・メディア工学講座 渡場 康弘 准教授 |
| 13:50 - 14:30 | Dockerを利用したTensorflowやPyTorchによる画像分類モデルの実行 講師：岡山理科大学 総合情報学部 Chonho Lee 教授 |
本講習会は10月15日に開催した同名の講習会と基本的に同じ内容です。
本講習会では並列プログラミング手法として一般的なOpenMP、MPI、ベクトルプロセッサで利用できる自動並列化機能による並列プログラミングの基礎と利用方法を説明します。スーパーコンピュータを1週間自由に使える「無料お試しアカウント」付きです。
OpenMPとは、プログラム中に"指示行"と呼ばれる記述を追加することでノード内並列化（共有メモリ並列処理）を行う方法です。指示行の挿入のみで並列化が可能なため、プログラミングの負担が少なく移植性が高いという利点があります。ただしノードを跨いだ並列化は行えないため、大規模な並列化を行うにはMPIと組み合わせてプログラミングを行う必要があります。なお、Fortran 言語と C 言語で記述が少し異なります。
MPIとは、分散メモリ並列処理におけるメッセージパッシング(複数のプロセス間でデータをやり取りするために用いるメッセージ通信操作)の標準規格のことです。ノード間をまたがる並列化が可能となるため、その分大きなメモリ空間が利用可能になります。ただし、ユーザ自身で処理の分割やノード間の通信を指示する必要があるため、プログラミングの負担がやや大きくなります。
新型コロナウイルス感染症の影響を鑑み、本講習会はオンライン会議ツールを用いたオンライン配信形式で行います。ネットワークに接続可能な環境をご用意ください。
OpenMP利用方法(SQUID)
MPI利用方法(SQUID)
MPI＋OpenMP利用方法(SQUID)
ベクトルエンジン向けC/C++コンパイラの使い方
ベクトルエンジン向けFortranコンパイラの使い方
並列プログラミング入門 OpenMP・自動並列
並列プログラミング入門 MPI
本講習会は10月7日に開催した「ベクトルプロセッサ 高速化技法の基礎」と基本的に同じ内容です。
本講習会では、SQUIDのベクトルノード群に搭載されているSX-Aurora TSUBASA（ベクトルプロセッサ）で動作するプログラムの高速化を目的とし、性能測定や基礎的なチューニング手法を説明します。スーパーコンピュータを1週間自由に使える「無料お試しアカウント」付きです。
Vector Engine 向け Fortran コンパイラの使い方
Vector Engine 向け C/C++ コンパイラの使い方
演習資料
本講習会は10月6日に開催した同名の講習会と基本的に同じ内容です。
本講習会では、GPUおよびGPUを用いた計算の特徴や概要を説明し、OpenACCによるGPUプログラミング手法の基礎を学びます。
本来はコンピュータの画像や映像の処理を担当する画像処理装置（Graphics Processing Unit）です。CPUと比べて複雑な命令は苦手ですが、単純な演算性能は非常に高いため、画像処理以外も行うGPGPU（General-Purpose GPU）として近年のスーパーコンピュータに搭載されています。GPUで計算を行うには、CUDAやOpenACCによるプログラミングが必要になります。
本講習会は9月16日に開催した同名の講習会と基本的に同じ内容です。
本講習会ではスーパーコンピュータでの計算に必要となる、ジョブスクリプトの投入による計算機利用（バッチ利用）の概要を説明し、サイバーメディアセンターのシステムを利用するためのジョブの投入方法を学びます。講習会の後半では応用テクニックやコンテナ利用など、高度なジョブの投入方法を紹介します。スーパーコンピュータを1週間自由に使える「無料お試しアカウント」付きです。
本講習会では、ONION-objectの概要について説明し、WebブラウザのGUIでの操作方法や、S3 APIを介した利用方法について学びます。ONION-objectを1週間お試しいただける「無料お試しアカウント」付きです。
ONION-objectはCloudian製のHyperStoreで提供されるオブジェクトストレージです。一般的なオンラインストレージと同じくWebブラウザのGUIを通してファイルのアップロードやダウンロード、アクセス制御が可能です。また、AWS S3互換のオブジェクトストレージのため、クラウド連携アプリケーションそのままの操作感で、オンプレミスのONION-objectを利用することが可能です。なお、ONION-objectはSQUIDやOCTOPUSとは独立したストレージであり、ご利用には別途お申込が必要になります。サービス概要や利用のご相談・お申込みは、こちらのページをご参照ください。
本講習会は6月18日に開催した同名の講習会と基本的に同じ内容です。
本講習会ではサイバーメディアセンターのスーパーコンピュータの基礎的な知識と、その使い方について学びます。大規模計算機システムを１週間自由に使用できる「無料お試しアカウント」を配布しますので、スーパーコンピュータを使った研究を検討している方に、大変おすすめできる内容となっています。大学や高等専門学校の教員・学生であれば、誰でも受講は可能となっておりますので、お気軽にご参加いただければと思います。
13:30 - 14:00 スパコンの概要とCMCのスパコンの紹介
14:00 - 15:30 スパコンの使い方
本講習会は6月14日に開催した同名の講習会と基本的に同じ内容です。
本講習会では、並列プログラミングについて、まったくの初心者向けにその手法や考え方の基礎について紹介します。また、大規模な並列計算が可能な大型計算機やコンピュータシステムを扱うのに必要となる Unix についても、まったくの初心者でも困らないように簡単な概観を提示します。こうした並列システム、並列プログラミングについてあまり触れたことはないが興味のある方、その上で学習、研究をしようと考えている方はぜひご参加ください。
新型コロナウイルス感染症の影響を鑑み、本講習会はオンライン会議ツールを用いたオンライン配信形式で行います。ネットワークに接続可能な環境をご用意ください。
R言語は、統計解析向けのプログラミング言語環境で、Pythonと並んで機械学習のライブラリが充実していることから、様々な分野での利用が期待されています。一方で、メモリ空間を大量に利用することでも知られており、大規模なデータを解析するためには大規模計算機システムが必要とされます。本セミナーでは一般的なRによるプログラミングと並列化の基礎、大規模計算機システムを用いた利用方法についてSQUIDを用いたハンズオン形式で行います。
大阪大学サイバーメディアセンターでは、本センターが利用負担金を全額支援する公募型利用制度の説明会を11月10日(水)に開催いたします。
本センターでは、大規模計算機システムを活用する研究開発の育成・高度化支援の観点から、今後の発展が見込まれる萌芽的な研究課題や、本センターの大規模計算機システムを最大限活用することで成果が見込まれる研究課題を公募しております。2022年度の公募型利用制度では、今後の発展が見込まれる萌芽的な研究課題を募集する「若手・女性研究者支援萌芽枠」、大規模計算機システムを最大限活用することで成果が見込まれる研究課題を募集する「大規模HPC支援枠」、人工知能技術を活用する研究課題を幅広く募集する「人工知能研究特設支援枠」から構成され、採択された場合は利用負担金が全額免除されます。本説明会では公募型利用制度の概要、申請書の書き方のコツについて説明します。具体的に申し込みを検討されている方向けの相談会も実施いたします。
多数の皆様方のご参加をお待ちしております。
| 15:00 - 15:20 | 公募型利用制度の概要（サイバーメディアセンター 伊達進 准教授） |
| 15:20 - 15:40 | 申請書の書き方（サイバーメディアセンター 木戸善之 講師） |
| 15:40 - 16:00 | 個別相談（希望者のみ） |
本講習会では、ONIONの基本構成、基本機能について説明し、データの格納・参照手段や活用事例、ニーズに応じた使い方について紹介します。
ONION(Osaka university Next-generation Infrastructure for Open research and open InnovatioN)とは、SQUIDと連携しているデータ集約基盤です。SQUIDのファイルシステムEXAScaler、WEBストレージサービスONION-file、オブジェクトストレージ ONION-objectで構成されています。
ONIONを活用することで、利用者のみなさまの環境とスーパーコンピュータ間のデータ移動が簡単になります。また、SQUIDやOCTOPUSのアカウントを持っていない海外や企業の共同研究者の方と即座に計算結果を共有する、スマートフォンからデータ操作をするといったことができるなど、様々な利用方法が考えられます。もちろん、研究室の研究データの保存・共有などにもお使いいただけます。
ONION（システム紹介）
ファイル転送方法（WEBブラウザ）
ファイル転送方法（S3）
本講習会では、SQUIDに導入されているSingularityを利用したコンテナジョブの投入方法と、コンテナのカスタマイズ方法を説明します。
ホストOS上で仮想環境を構築する仮想化技術の1種です。SQUIDのように多数のユーザで共用するスーパーコンピュータシステムにおいても、Singularityコンテナ内ではユーザ自身で必要なソフトウェアをインストールすることができ、柔軟な環境構築が可能です。また、Docker Hub などのコンテナ共有サービスでは有志が作成した多数のコンテナが公開されており、それらをダウンロード、カスタマイズして利用することもできます。
本講習会では並列プログラミング手法として一般的なOpenMP、MPI、ベクトルプロセッサで利用できる自動並列化機能による並列プログラミングの基礎と利用方法を説明します。スーパーコンピュータを1週間自由に使える「無料お試しアカウント」付きです。
OpenMPとは、プログラム中に"指示行"と呼ばれる記述を追加することでノード内並列化（共有メモリ並列処理）を行う方法です。指示行の挿入のみで並列化が可能なため、プログラミングの負担が少なく移植性が高いという利点があります。ただしノードを跨いだ並列化は行えないため、大規模な並列化を行うにはMPIと組み合わせてプログラミングを行う必要があります。なお、Fortran 言語と C 言語で記述が少し異なります。
MPIとは、分散メモリ並列処理におけるメッセージパッシング(複数のプロセス間でデータをやり取りするために用いるメッセージ通信操作)の標準規格のことです。ノード間をまたがる並列化が可能となるため、その分大きなメモリ空間が利用可能になります。ただし、ユーザ自身で処理の分割やノード間の通信を指示する必要があるため、プログラミングの負担がやや大きくなります。
新型コロナウイルス感染症の影響を鑑み、本講習会はオンライン会議ツールを用いたオンライン配信形式で行います。ネットワークに接続可能な環境をご用意ください。
OpenMP利用方法(SQUID)
MPI利用方法(SQUID)
MPI＋OpenMP利用方法(SQUID)
ベクトルエンジン向けC/C++コンパイラの使い方
ベクトルエンジン向けFortranコンパイラの使い方
並列プログラミング入門 OpenMP・自動並列
並列プログラミング入門 MPI
本講習会では、SQUIDのベクトルノード群に搭載されているベクトルプロセッサ（SX-Aurora TSUBASA）で動作するプログラムの高速化を目的とし、性能測定や基礎的なチューニング手法を説明します。スーパーコンピュータを1週間自由に使える「無料お試しアカウント」付きです。
Vector Engine 向け Fortran コンパイラの使い方
Vector Engine 向け C/C++ コンパイラの使い方
演習資料
本講習会では、GPUおよびGPUを用いた計算の特徴や概要を説明し、OpenACCによるGPUプログラミング手法の基礎を学びます。
本来はコンピュータの画像や映像の処理を担当する画像処理装置（Graphics Processing Unit）です。CPUと比べて複雑な命令は苦手ですが、単純な演算性能は非常に高いため、画像処理以外も行うGPGPU（General-Purpose GPU）として近年のスーパーコンピュータに搭載されています。GPUで計算を行うには、CUDAやOpenACCによるプログラミングが必要になります。
ミニキャンプ実施期間中、本センターではSQUID GPUノードを提供いたします。SQUIDのGPU 1ノードを2チームで利用いただき、1チームあたり4GPUをご利用いただけます(初日の9月28日と最終日の10月１日は参加者および関係者のみで使える設定となりますが、それ以外は他の利用者との共有利用になります)。ミニキャンプ終了後も、10月8日まで引きつづき無償でご利用いただけます。
SQUIDのシステム詳細はこちらをご覧ください。
Zoomへの接続は 9:30 より行っていただけます。
| 10:00 - 10:10 | 趣旨説明 |
| 10:10 - 12:00 | キャンプ事前準備 - 参加者の自己紹介・課題紹介 - スーパーコンピュータSQUIDの紹介 - SQUIDへのログイン |
| 12:00 - 13:00 | 昼食休憩 |
| 13:00 - 16:30 | 実践(自由に離席、休憩可能) |
| 16:30 - 16:50 | 進捗確認 |
各自で課題に取り組んでいただきます。この間、メンターとはslackでは繋がっていますので適宜ご相談いただけます。(ベストエフォート対応となりますので、即座に回答がくるとは限らない点はあらかじめご了承ください)
Zoomへの接続は 9:30 より行っていただけます。
| 10:00 - 10:30 | 情報交換（これまでの結果等について情報共有） |
| 10:30 - 16:00 | 実践（自由に離席、休憩可能） |
| 16:00 - 17:00 | 成果報告 |
本講習会ではスーパーコンピュータでの計算に必要となる、ジョブスクリプトの投入による計算機利用（バッチ利用）の概要を説明し、サイバーメディアセンターのシステムを利用するためのジョブの投入方法を学びます。講習会の後半では応用テクニックやコンテナ利用など、高度なジョブの投入方法を紹介します。スーパーコンピュータを1週間自由に使える「無料お試しアカウント」付きです。
