当該エラーメッセージは、qsub/qstatコマンドのライセンス数制限を超過していることを示しています。
ライセンス数は十分な数を用意しておりますが、コマンドの実行が集中した場合に、一時的に不足する可能性があります。
当該エラーメッセージを確認された場合は、以下からご連絡くださいませ。
お問い合わせフォーム
ジョブの投入時間と経過時間の指定により、実行されるタイミングがやや異なりますが、基本的には正しく実行されます。
※共有利用の場合は、他の利用者の投入状況によって実行されない場合がございます。
詳細は下記をご覧ください。
投入したジョブの実行終了予定時刻が、メンテナンス開始時刻を超えていた場合、メンテナンス終了後まで実行されません。
実行終了予定時刻は、「投入時間」とジョブスクリプトに記載した「経過時間の指定(elapstime_req)」から算出します。
例えば、ジョブスクリプトに「elapstime_req=5:00:00」と記載したジョブを、13:00に投入した場合、
実行終了予定時刻は18:00となります。
※共有利用の場合は、上記に関わらず、他の利用者の投入状況によって実行されない場合がございます。
※年度末メンテナンスの場合、メンテナンス終了時点で全てのジョブを削除します。
正常に実行されます。(メンテナンスの終了を待たずに実行可能です)
前述の通り、メンテナンス終了後まで実行されません。
投入されたジョブはQUE状態のまま受け付けられ、メンテナンス終了後に実行されます。
年度末メンテナンスの場合、全てのジョブが削除されますのでご注意ください。
「経過時間の指定(elapstime_req)」を調整し、
実行終了予定時刻がメンテナンス時刻を超えないようにして、再投入することで、実行できる可能性があります。
もしお急ぎの場合は、お試しください。
占有利用等で、長時間のジョブを実行されている方が対象となります。
メンテナンス開始までは正常に実行されます。
メンテナンス中は、計算を実行できませんので、停止をお願いすることがございますが、ご了承ください。
該当している場合、こちらからご連絡いたします。
メンテナンス終了後まで実行されません
投入されたジョブはQUE状態のまま受け付けられ、メンテナンス終了後に実行されます。
正常に実行されます。
各コンパイラのマニュアルをご参照ください。
マニュアルは下記に置いております。閲覧いただく場合、利用者番号での認証が必要となります。
接続方法はこちらをご覧ください。
ログイン方法
HPCIやJHPCN-HPCIシステムで利用する場合は、こちらをご覧ください。
ログイン方法(HPCI利用者向け)
当センターで提供しております大規模計算機システムの利用資格、利用規定を下記に掲載しております。ご覧くださいませ。
環境変数やオプションはsetenvも設定できますが、マルチノードでジョブを実行した場合は、
スレーブノードにsetenvで指定した環境変数が設定されません。
マルチノードでジョブを実行する場合は、NQSIIの-vオプションをご利用ください。
#PBS -v [環境変数orオプション]=[設定内容]
のように指定します。
以下のコマンドを実行することで、
ジョブの予約状況を確認することが可能です。
sstat
実行開始時刻が決定していると、
STT(スケジューリング状態)がASG(Assigned)となり、PlannedStartTime（実行開始予定時間）に開始時刻が表示されます。詳細は下記をご覧ください。
スクリプトファイルにおける、制御コードに問題がある可能性があります。
当センターのシステムでは、文字コードはUTF-8となっておりますので、パソコンからファイル転送する際は、アスキーコードで送付するか、nkf コマンドで文字コード・改行コードを変換する必要があります。
ジョブは各利用者様の優先度に応じて、スケジューリングされますので、場合によっては待ち時間が発生することがあります。
以下のコマンドを実行することで、ジョブの予約状況を確認することが可能です。
sstat
実行開始時刻が決定していると、
STT(スケジューリング状態)がASG(Assigned)となり、PlannedStartTime（実行開始予定時間）に開始時刻が表示されます。詳細は下記をご覧ください。
あまりに長時間の待ちが発生する場合は、何らかの制限に抵触しているか、もしくはシステムに問題がある可能性があります。以下までご連絡ください。
system{at}hpc.cmc.osaka-u.ac.jp
「qwait」コマンドを使用することで、実現可能です。
このコマンドは引数で与えたリクエストID(例：12345.cmc)を待ち合わせするというものです。
指定のリクエストIDのジョブが終了するとメッセージ終了と共にコマンドが終了します。
コマンドの詳細についてはポータルで公開されておりますマニュアル
「NQS利用の手引」のリファレンス編 第1章 ユーザコマンドをご参照頂けますようお願い致します。
NQSII利用の手引き(要認証)
NQSV利用の手引き
※ man qwait でもヘルプを参照できます。
qwait については下記のような使い方が可能です。
監視スクリプトをバックグラウンド実行し、スクリプト内で qwaitを実行します。
exitコード(上記のマニュアルに記載があります)で判定し、その後の動作を分岐させています。
参考にしてください。
-----------
$ qsub job1-1
Request 12345.cmc submitted to queue: Pxx.
$ (./chkjob >& log &)
----- chkjob
#!/bin/sh
while :
do
qwait 12345.cmc #リクエストIDを任意のものに変更して下さい
case $? in
0) qsub job1-2;exit;;
1) qsub job2-1;exit;;
2) qsub job3-1;exit;;
3) echo NQS error | mail xxxx@yyyy.ac.jp;exit;;#メールアドレスを任意のものに変更してください
7) continue;;
*) ;;
esac
done
------------
以上です。
このエラーの原因は基本的に以下の２つのどちらかとなります。
改行コードがCRLFのファイルはエディタ(vi,emacsなど)で開いた際、画面下に[DOS]と表記されます。
アップロードする前の対処方法としては下記の通りです。
またアップロード後であっても、フロントエンドノード上で以下のコマンドを実行することで、
改行コードがCRLFからLFに変換されたsample2.shが生成されます。
sed 's/\r//g' sample.sh > sample2.sh
SX用クロスコンパイラの場合、下記のようにコンパイルすることが可能です。
% sxc++ -S a.c
% sxf90 b.f90 a.s
intelコンパイラの場合、下記のようにコンパイルすることが可能です。
% icc -c a.c
% ifort b.f90 a.o
