This page shows research achievements and results from the users of our large-scale computer systems.



界面での分子の挙動解析

Author: KOBASYASHI Takuji 
Affiliation: NTN Next Generation Research Alliance Laboratories, Graduate School of Engineering, OSAKA UNIVERSITY

(目的)鉄表面での硫化物の挙動を明らかにする。
(内容)第一原理計算パッケージを利用し、想定される鉄表面上の硫化物構造のエネルギーを計算し、反応経路探索を行った。
(結果)鉄表面で硫化鉄が分解し硫化鉄が生成される過程に関する知見を得た。

Simulation study of cardiac electrical excitation using virtual heart model

Author: Shin Inada¹ Ryo Haraguchi² Takashi Ashihara³ Kazuo Nakazawa⁴ 
Affiliation: Morinomiya University of Medical Sciences¹ University of Hyogo² Shiga University of Medical Science³

仮想心臓モデルを構築し,電気生理学的シミュレーションを行うことで不整脈のメカニズム解明や,予防・診断に役立たせることを目指している.心筋細胞の電気的興奮に伴う電位変化(活動電位)を再現することが可能なユニット約300万個を組み合わせて心房モデルを構築した.洞結節から発生した電気的興奮が心房内を伝播する間に不整脈を誘発させる電気刺激を左心房に与え,不整脈を誘発させた.不整脈を誘発する電気刺激を与えるタイミングを変更しながらシミュレーション実験を繰り返し,不整脈の誘発性および持続性について検討した.その結果,心筋細胞の電気生理学的特性や細胞間の電気的結合が不整脈の持続性に影響を与えることが明らかとなった.

Development of the cross-reference framework between different parallel computer systems

Author: Zhou Jingde 
Affiliation: 京都大学 情報学研究科

  Authors:Zhou Jingde Affiliation:Graduate School of Informatics, Kyoto University Abstract:It is a project adopted for Research Proposal Based Use in FY 2022.  

Radiation Hydrodynamic Simulation Study on Laser-produced Plasmas

Author: 砂原淳¹, 粂田智洋², 城﨑知至², 難波愼一², 森田大智³, 山本直嗣³ , 森田大樹⁴, 久米真樹⁴, 空本龍弥⁴, 新沼大登⁴, 杉浦使⁴, 中山勇冬⁵, 東口武史⁴,富田健太郎⁶, 西原功修⁷ 
Affiliation: School of Nuclear Engineering, Purdue University¹, Graduate School of Advanced Science and Engineering, Hiroshima University², Interdisciplinary Graduate School of Engineering Sciences, Kyushu University³, School of Engineering, Utsunomiya University⁴, Graduate School of Regional Development and Creativity, Utsunomiya University⁵, Faculty of Engineering, Hokkaido University⁶, Institute of Laser Engineering, Osaka University⁷

我々の研究目的は輻射流体シミュレーションにより、レーザー生成プラズマのモデリングを行うことにある。レーザー生成プラズマは幅広い分野で使われており、我々が計算対象とするのはレーザー核融合、レーザープラズマ光源(極端紫外光源)、レーザー核融合ロケットの磁気スラスター、レーザーアブレーション加工等である。これらを研究する日本の各大学と共同研究を行い、輻射流体シミュレーションと実験結果を比較し、実験のモデリングのみならず、レーザー生成プラズマの学理を明らかにする。また、シミュレーションの計算精度を実験結果との比較から確認し、輻射流体コード開発に活かす。本年度、2次元輻射流体シミュレーションの計算精度向上を図ると共に、実験で観測される複雑なレーザー生成プラズマのダイナミクスを解析した。

Origin of the nucleation preference of coherent and semicoherent nanoprecipitates in Al–Cu alloys based on atomistically informed classical nucleation theory

Author: Heting Liao, Yujie Jia, Yangen Li, Shihao Zhang, Hossain Rana, Dan Wei, Fanshun Meng, Junping Du, Shuhei Shinzato, Shigenobu Ogata 
Affiliation: Department of Mechanical Science and Bioengineering, Graduate School of Engineering Science, Osaka University.

The age-hardening response during the heat-treatment process of Al–Cu alloys is significantly and non- linearly influenced by the type and size of metastable precipitates formed. In Al–Cu alloys, a semicoherent phase, usually observed after the formation of coherent Guinier–Preston (GP) zones during aging, is the key strengthening precipitate. Thus, identifying the energetics of preferential nucleation of these precipitates is essential for clarifying the optimal conditions for the formation of precipitates that effectively contribute to hardening. In this study, using classical nucleation theory (CNT) along with a recently developed machine-learning-based interatomic potential with near first-principles accuracy, we characterized the nucleation preference of coherent GP zones and semicoherent θ’ nanoprecipitates in Al–Cu alloys at various temperatures and solute concentrations. Our atomistically informed CNT model revealed the overall temperature and solute-concentration dependencies of the nucleation barriers of the nanoprecipitates, which determine the crossover temperatures at which the ease of formation of each precipitate alternates at the solute concentration of interest. The predicted results were in good agreement with the previous experimental observations. The findings of this study contribute to furthering the understanding of the driving forces for nucleation of precipitates in Al–Cu alloys at an atomic level and provide theoretical guidance for identifying the optimal age-hardening response.

Numerical Study on Compressible Viscous Flow including Supersonic Combustion

Author: 坪井伸幸 
Affiliation: 九州工業大学大学院工学研究院機械知能工学研究系

極超音速流中に置かれたランプ周りの流れ場構造を把握するために,3次元非定常圧縮性粘性解析を行った.Re数は低いため層流としている.この解析により,3重点と強い弓形衝撃波を伴う衝撃波構造や壁面熱流束への影響を把握した.

DFT studies on [2+2+1]-cycloaddition reaction of early transition metal imido and -carbene complexes with alkyne

Author: Takuya Akiyama, Akira Yamamoto, Tokiya Teraishi, Daisuke Senga, Yu Kuroda, Mohri Tomohiro, Hayato Tsurugi, 
Affiliation: Graduate School of Engineering Science, Osaka University

前周期遷移金属のイミド錯体・カルベン錯体とアルキンとの[2+2+1]-環化付加反応について、DFT計算による反応経路の解析と各反応過程にかかる自由エネルギーの計算を行った。特に、中心金属の違いが与える反応経路および活性化エネルギーへの影響を詳細に調査することで、本反応に対して最も高い反応活性を示す金属錯体を明らかにした。

Direct numerical simulation for the validation of denoising techniques in the image measurement of turbulent convective heat transfer

Author: Yutaka Oda 
Affiliation: Faculty of Engineering Science, Kansai University

各種工業機械で見られる流れの多くは伝熱を伴う乱流場であり,熱設計のさらなる高度化に向けて乱流熱伝達の時空間変動の詳細を把握する必要がある。本研究では乱流熱伝達率の時系列画像計測で問題となる画像ノイズの低減手法を評価する目的で,実験と同様の平行平板間乱流を対象とした直接数値シミュレーションを行った。

Development of geometric deep learning for physics simulations and conputer vision

Author: Takashi Matsubara 
Affiliation: Graduate School of Engineering Science, Osaka University

データが持つ対称性などの幾何学的構造を保存する深層学習である幾何学的深層学習を開発し,物理シミュレーションとコンピュータビジョンに応用する.これによって,データからの保存則の発見,生成モデルの意味空間の幾何学的構造の利用,距離同変な畳み込み演算などを実現する.

Distant Supervised Relation Extraction of Gene-Gene Interactions

Author: Kiwamu Arakane 
Affiliation: Institute for Protein Research, Osaka University

深層学習モデルを用いた自然言語処理により、文献から自動的にシグナル伝達ネットワークを抽出することを目指す。そのための重要なステップとして遺伝子間の関係性を推定する必要があり、そのために遠距離教師あり学習手法を用いて関係性抽出を行うモデルを学習させた。

Atomistic simulation of solid state convection on nanostructured metal under super thermal field

Author: Shuhei Shinzato, Shihao Zhang, Fanshun Meng, Junping Du, Shigenobu Ogata 
Affiliation: Graduate School of Engineering Science, Osaka University

108K/mを超える非常に大きな温度勾配(超温度場)に置かれたナノ金属材料において、内部が固相を保ったまま対流に類似した原子拡散が起きることが実験により観察された。本研究では超温度場におけるナノ材料の固相対流現象の詳細を原子シミュレーションを用いて明らかにするために、非平衡分子動力学法により材料内部の原子拡散挙動および低温側接点界面における原子分布及び発生する応力の解析を行った。その結果、表面において高温側から低温側へ、内部において低温側から高温側への原子拡散が生じること、および界面において内部と外周で原子の密度が異なり、それによりback-stressが生じていることが明らかになった。

Clarification of molecular orbitals for cerium-containing multi-metallic clusters by DFT calculation

Author: Tomomi Kawakami, Sota Tamaki, Kouma Matsuzaki, Hiroki Mori, Haruki Nagae, Hayato Tsurugi 
Affiliation: Graduate School of Engineering Science, Osaka University

セリウムを含む多核金属錯体が光応答性を示す性質を軌道エネルギー準位に基づいて理解することを目的として、セリウムのみからなる6核金属錯体や、セリウムと他の複数の金属元素からなる多核金属錯体の電子状態解析を行った。特に4価のセリウムを含む多核金属錯体が可視光領域に吸収を持つ最大の要因が、セリウム中心の低い4f軌道に由来することを明らかにした。

Analysis of the spectrum of dark matter axions produced from strings

Author: Kenichi Saikawa 
Affiliation: College of Science and Engineering, Kanazawa University

  Authors:Kenichi Saikawa Affiliation:College of Science and Engineering, Kanazawa University Abstract: It is a project adopted for Research Proposal Based Use in FY 2022.  

Spatially resolved synthetic modelling of building energy demand

Author: Yohei Yamaguchi 
Affiliation: Graduate School of Engineering, Osaka University

開発モデルはGISや国勢調査などの利用可能な統計情報から対象地域に立地・居住する業務施設・世帯を生成し、生成した業務施設・世帯に対して建築仕様、設備仕様等に関する多数のエネルギー需要決定因子を組み合わせて付与するSyntheticアプローチを採用した。各業務施設、住宅のエネルギー需要推計では、施設利用者、住宅世帯構成員の生活行動を確率モデルにより生成し生活行動に基づいてエネルギー需要を定量化する。このような仕様により将来における技術普及がもたらすエネルギー需要および二酸化炭素排出量の変化を推計可能である。開発モデルにより、東京都世田谷区、三鷹市、調布市、狛江市の民生家庭部門、業務施設ストックの二酸化炭素排出量削減可能性の評価を実施し、開発モデルが有用であることを確認した。加えて、日本全国の家庭部門のエネルギー需要を市区町村単位で推計、可視化し、長期変化の推計を行った。

電離層中のイオンのサイクロトロン運動

Author: Chihiro Yamanaka 
Affiliation: Department of Earth and Space Science, Graduate School of Science, Osaka University

高度 200 km を想定し、電場 Ey = 0.1 m V / m、Bz = 25000 n T、O, O2, N2 の数密度をそれぞれ 1016 / m3とし、イオンのサイクロトロン運動の軌跡を求めた。中性粒子との衝突の効果が極めて大きいことが示された。

A rapid screening method for protein-protein interactions using AI program

Author: Kawaguchi Shinichi 
Affiliation: Osaka University, Graduate School of Frontier Biosciences

生命現象の根幹であるタンパク質の働きは、多くの場合、相互作用を通じて発揮される。大規模なタンパク質間の相互作用候補について、AIによる複合体予測を行い、生化学的実験へのボトルネックを緩和することが期待されている。本研究では、生殖細胞に存在するタンパク質集積体(ヌアージュ顆粒)に局在する20種類のタンパク質間について、AlphaFold2を用いた複合体予測を行った。Spn-EとTejというタンパク質ペアの場合、Tejタンパク質のC末側ドメインがSpn-Eと相互作用することが予測された。その他にも、高いスコアを示すタンパク質ペアが得られており、in silicoスクリーニングの有効性が示された。

Development of a framework for physical modeling and simulation based on deep learning

Author: Takaharu Yaguchi 
Affiliation: Graduate School of System Informatics, Kobe University

  Authors:Takaharu Yaguchi Affiliation:Graduate School of System Informatics, Kobe University Abstract:It is a project adopted for Research Proposal Based Use in FY 2022.  

Action on multiserver nodes in a large closed BCMP queueing network.

Author: Yuki Komiyama, Haruka Oba, Shinya Mizuno. 
Affiliation: Department of Computer Science, Faculty of Informatics, Shizuoka Institute of Science and Technology.

待ち行列理論の実社会への適用を目的に、待ち行列モデルの中でも柔軟なBCMP待ち行列ネットワークに対し、複数窓口に対応できるように、平均値解析法に並列計算を取り入れ、大規模閉鎖型モデルに対して計算を実施し、複数窓口に対応した大規模閉鎖型BCMP待ち行列ネットワークの性能評価指標の算出を行うことで、再帰計算におけるメモ化の有効性及び窓口数の増加による計算時間の変化を確認した。

Numerical simulation on smoke flow in a tunnel fire

Author: Futoshi Tanaka¹ Shoichi Kume² 
Affiliation: Mechanical Engineering, University of Fukui¹ Graduate School of engineering Doctoral Program, University of Fukui²

火災に特化したCFDコードの一つであるFire Dynamics Simulatorを使用して、トンネル火災時における煙流動の様子について数値シミュレーションを行った。CFDコードをOCTOPUSにて使用できる状態にして、各種テストを実施した。その後、数値シミュレーションと模型実験を比較して計算モデルの妥当性に関して検証した。

Molecular dynamics simulation for thermal engineering at microscale

Author: Masahiko Shibahara, Kunio Fujiwara 
Affiliation: Osaka University, Graduate School of Engineering, Department of Mechanical Engineering

ナノ・マイクロメートルスケールのエネルギー輸送現象を原理的に理解して制御することを目的として,伝熱面の濡れ性やナノメートルスケールの微細構造が密度欠損長さと固液界面熱抵抗の関係に与える影響を分子動力学解析により調査した.また担体と接するナノ粒子の触媒反応に伴うエネルギー分配割合を分子動力学解析により詳細に調べた.そのためにOCTOPUSを用いた.

First principle studies on C-C bond formations in electrochemical CO2 reduction reactions

Author: Kazuhide Kamiya 
Affiliation: Research Center for Solar Energy Chemistry, Graduate School of Engineering, Osaka University.

CO2電解による有価物質生成におけるキープロセスであるC-C結合生成反応は銅系触媒のみが高い活性を有する。本課題では第一原子分子動力学を用いて、この銅系触媒のC-C結合生成に関する作動原理の解明を目指した。金属銅上では中間体COの吸着エネルギーが適度な値を有することで、CO二量化反応とそれに続くプロトン移動反応の活性化エネルギーが小さく抑えられていたことが明らかになった。

Polymer database construction by molecular dynamics simulation

Author: Yuri Ichioka 
Affiliation: R&D Digital Transformation Dept. Informatics Initiative Digital Value Co-Creation ASAHI KASEI CORPORATION

(目的) MIによる高機能ポリマー探索を行うため、分子動力学計算データベース(DB)を構築すること。
(内容)大量のポリマー種に対し、分子動力学計算ソルバーのLAMMPSを用いて複数の物性値を計算、その結果を蓄積することでDB構築を行う。
(結果)約3000種のポリマーに対し密度や比熱等の物性計算を実行、MIに用いるためのDB構築が完了した。

Phenomenological description of fluid motion at atomistic scales

Author: Takeshi Omori 
Affiliation: Department of Mechanical Engineering, Osaka Metropolitan University

近年のMEMS技術の進展に伴い,微小流路内での流動制御の重要性が増しているが,制御のベースとなる現象論(例えば壁面上での流速に対する境界条件)は未確立である.本研究では,分子動力学法による計算結果を流体力学に基づき解析し,微小スケールにおける流体がしたがう壁面境界条件について,特に壁面の分子スケールの粗さが固液摩擦に及ぼす影響について調査した.

Structure search of silicene on the Ag(111) surface based on evolutionary algorithms and Gaussian process regression

Author: Yuji Hamamoto 
Affiliation: Graduate School of Engineering, Osaka University

  Authors:Yuji Hamamoto Affiliation:Graduate School of Engineering, Osaka University Abstract:It is a project adopted for Research Proposal Based Use in FY 2022.  

Large Eddy Simulation of a liquid film flowing over a rotating disk

Author: Masanobu Sato 
Affiliation: SCREEN Semiconductor Solutions Co.,Ltd. , Equipment Elemental Technology Development 4, Equipment Elemental Technology Development Department 1, Clean Technology Development Operations

回転する直径300mmのウェハモデルの中心供給された水が、基板上で広がる状態を 、OpenFOAMを使用して下記条件を組み合わせて計算した。
Software OpenFOAM v2012
ソルバー interFoam
Mesh数 26.3M
界面補足法 VOF
Turbulence Model LES
流量条件: 0.45LPM, 0.9LPM, 2LPM
回転数:800rpm, 1000rpm
粘度 : 1cP, 2.6cP
結果: 流量は、液膜厚よりも液速度に与える影響が大きいことや、粘度が高いと液広がり速度が低下する事などの結果を得た。
※この成果は、国立研究開発法人新エネルギー・産業技術総合開発機構(NEDO)の「ポスト5G情報通信システム基盤強化研究開発事業」(JPNP20017)の結果得られたものです。

Development of a method for predicting physical properties of new materials using the GAN method

Author: Tamio Oguchi¹ Hiroshi Matsumoto² Kohei Hashimoto³  
Affiliation: OSAKA University, OSAKA, Japan¹ DAIKIN INDUSTRIES, LTD., OSAKA, Japan² DAIKIN INDUSTRIES, LTD., OSAKA, Japan³

ダイキン工業ではMaterials Informatics(MI)の導入を推進し、様々なフッ素材料の開発にMIを活用しているが、MIの物性予測モデル構築には大量の学習データを必要とする。しかし、現場には学習データに適したデータは少なく、データ不足がモデル開発に支障を来すケースもある。本研究では学習データ不足を解決するため、高精度な疑似画像を生成できる敵対的生成ネットワーク(GAN:Generative Adversarial Network)を用いた物性予測モデルの開発について検討を行う。今年度はデモ画像データを用いてSQUID上でGANが稼働し、高精度な疑似画像が生成できることを確認した。次年度からはダイキン工業において実際に取得した材料の画像データを適用する。

Analysis of particle behavior in fluid

Author: KOBASYASHI Takuji 
Affiliation: NTN Next Generation Research Alliance Laboratories, Graduate School of Engineering, OSAKA UNIVERSITY

(目的)流体中の粒子挙動を計算し、粒子が流体物性に与える影響を明らかにする。
(内容)粒子の形状等を変更し、それらが流体物性に与える影響を調査した。
(結果)粒子の形状等が流体物性に与える影響を数値計算の観点から明らかにすると共に、実験との整合を得た。

Effects of incorporating a deep-unfolding framework into a deep neural network: implications for image restoration

Author: Tatsuki Itasaka, Masahiro Okuda 
Affiliation: Doshisha University Faculty of Science and Engineering

ディープラーニングを用いた画像復元手法では,一般的に高い性能を得るDeep-learningを用いた画像復元手法では、一般的に高い性能を得るために大規模なデータセットが必要となるが、取得コストによってそのようなデータセットの取得が困難なタスクも存在する。このような場合、データセットが小さくなりがちで、小さなデータセットで学習したモデルではオーバーフィッティングや低い汎化性能が発生する。このような問題を回避するために、モデルベースの最適化手法が画像復元に広く採用されている。そこで、本論文では、ディープニューラルネットワークとディープアンフォールディングネットワークを組み合わせることで、特に学習データ量が限られているという非理想的な条件下で、汎化性能を向上させる方法を提案します。ディープニューラルネットワークは、ディープアンフォールディングネットワークの前処理を行う。提案手法をノイズ除去や画素補間のための小規模データセットに適用し、ディープニューラルネットワークの汎化性能が向上していることを確認した。

Large-scale genomic analysis of streptococcal species to identify virulence factors

Author: Masayuki Ono;Masaya Yamaguchi 
Affiliation: Graduate School of Dentistry, Osaka University

  Authors:Masayuki Ono;Masaya Yamaguchi Affiliation:Graduate School of Dentistry, Osaka University Abstract:It is a project adopted for Research Proposal Based Use in FY 2022.  

Implementation and benchmarking of a quasi-classical mapping dynamics simulation method program

Author: Hirotaka Kitoh-Nishioka¹・Akihiro Kimura² 
Affiliation: Faculty of Science and Engineering, Kindai University¹・Graduate School of Science, Nagoya University²

多くの色素サイトを持つ光合成系の光捕集機構を調べるために、電子非断熱分子動力学シミュレーションのプログラムを実装しベンチマークを行うことを目的とした。2019年に提案された新規準古典マッピング動力学法である修正線形化半古典(mLSC)法を採用し、MPIによる並列化プログラム実装した。その結果、FMO光合成アンテナ蛋白質3量体に対する24サイトモデルの励起エネルギー移動を、SQUID汎用CPUノード群・4ノード並列でシミュレートすることに成功した。

Automatic Colorization for Character Illustration using Deep Learning

Author: Kenta Akita 
Affiliation: Kyushu University Graduate School of Design

本研究では、カラーイラスト制作において、非常に手間のかかる、手書きイラスト線画の着色の自動化を目指す。線画の自動着色では、ユーザが色の指定を行えるようにするため色ヒントの入力が可能な場合が多く、本研究では色ヒントとして参照画像を使う。自動着色を行う際に、既存研究では、色のみの反映しかできないため、瞳の詳細やハイライトの反映も可能にし、より人が行う着色に近い、自動着色を本研究では目指している。

Quantum chemical calculations with quantum classical hybrid algorithm and their parallelisation

Author: Wataru Mizukami 
Affiliation: Center for Quantum Information and Quantum Biology, Osaka University

近年、古典コンピュータと量子コンピュータがそれぞれ得意なところを担当する量子古典混合アルゴリズムが注目を集めている。本研究では、並列計算を用いることでこの量子古典混合アルゴリズムのシミュレーションの高速化を図った。具体的には、量子古典混合アルゴリズムの代表格である変分量子固有値法(VQE)のシミュレーションの並列化に取り組んだ。量子回路エミュレータにはcuQuantumを用い、量子回路パラメータ勾配をMPI並列を使いプロセスごとに独立に求める方法を採用した。開発したコードを用いて、14量子ビットを使った水分子のVQE計算を使いGPUノードに於いてベンチマークをとった。1ノード8GPUで556秒、2ノード16GPUで279秒と高速化が達成された。

Clinical Application of Deep Learning Technique for Medical Image Segmentation of Three-dimensional Organ Structures Available for Surgical Planning and Training in Cardiovascular Surgery

Author: Takashi Shirakawa 
Affiliation: Suita Tokushukai Hospital

  Authors:Takashi Shirakawa Affiliation:Suita Tokushukai Hospital Abstract:It is a project adopted for Research Proposal Based Use in FY 2022.  

Study of electron flux characteristics generated by kinetic laser absorption processes

Author: Yuji TAKAGI 
Affiliation: Department of Physics, Graduate School of Science, Osaka University/Institute of Laser Engineering, Osaka University

電磁プラズマシミュレーションコードを用いて,強度1014-16 W/cm2 のレーザーと臨界密度以下のプラズマとのピコ秒スケールの運動論的相互作用における高速電子の発生について調べた.境界条件を変えた高解像度大規模計算を行い,シミュレーションの解像度や境界条件が高速電子発生に影響していないことを確かめた.今後発生機構等についてより詳しく調べる予定である.

Analysis of differentially changed genes under gene perturbations.

Author: Tatsunori Nishimura 
Affiliation: Cancer Research Institute, Kanazawa University

コントロール群と一つの遺伝子発現をノックアウトした群でRNAシークエンスを行い、得られた生データをプロセッシングした。その後、二群間比較を行い、有意に変化した遺伝子をスクリーニングした。その結果、多くの遺伝子で発現変動が見られた。今後、その中でも意義のある変動遺伝子を実験により検証する。

Underwater antenna design for marine propeller operation monitoring

Author: SUGA, Ryotaro 
Affiliation: National Institute of Information and Communications Technology (NICT)

本研究では、陸上の既存無線通信システムとの周波数共用を可能とし、かつ舶用プロペラモニタリングシステムに適用可能なアンテナの設計及びプロペラを含む船舶を構成する部品周囲の電磁界分布を定量的に明らかにすることを目的として、FDTD法を用いたシミュレーションを行った。謝辞 本研究開発は総務省SCOPE(受付番号JP215003003)の委託を受けたものです。

First principles calculations of oxygen vacancy in rutile TiO2

Author: Masaki Ninomiya, Tetsuya Tohei, Yusuke Hayashi, Akira Sakai  
Affiliation: Osaka University, School of Engineering Science

TiO2中の酸素空孔とその局所集積により形成する剪断面構造は、メモリスタ(不揮発抵抗変化)特性をはじめとするTiO2の物性に大きな影響を及ぼすことが知られている。本研究では、TiO2中酸素空孔の挙動と剪断面構造との相関を明らかにすることを目的として第一原理計算にもとづく解析を行った。代表的な剪断面である(121)および(132)剪断面を含む欠陥構造スーパーセルモデルを構築し、剪断面近傍サイトにおける酸素空孔の形成および移動の過程のエネルギーを系統的に評価した。

Identification of Cofactor Specificity-Contributing Residues in Enzyme

Author: Sou Sugiki, Teppei Niide, Yoshihiro Toya, Hiroshi Shimizu 
Affiliation: Department of Bioinformatic Engineering, Graduate School of Information Science and Technology, Osaka University

任意の酸酵素の補酵素特異性に影響するアミノ酸残基を機械学習モデルで調査し、補酵素特異性に関わる重要残基の位置を立体構造予測により推定することを目的とした。酸化還元酵素の全てのアミノ酸残基を説明変数として機械学習を実施することで、補酵素特異性に関わるアミノ酸残基を同定し、同定された残基は立体構造のどこに位置するかをタンパク質の構造予測により推定することに取り組んだ。その結果、機械学習モデルよりある酸化還元酵素の補酵素特異性に関わるアミノ酸残基の同定に成功した。同定されたアミノ酸残基の位置をRosettaソフトウェアを用いた構造予測により位置を推定したところ、補酵素との相互作用部位だけでなく、その立体的に外側の領域も重要であることが明らかとなった。

Molecular dynamics simulations of slow dynamics in glassy systems

Author: Kang Kim 
Affiliation: Graduate School of Engineering Science, Osaka University

直鎖状高分子は絡み合いによってダイナミクスが理解されるが、環状高分子に対する理論モデルは未だ確立していない。近年になって、環状高分子溶融体においてランダムに複数の高分子鎖をピン留めすると拡散が完全に抑制されることから、ガラスの遅いダイナミクスとのアナロジーが示唆され注目を集めている。 我々はこれまでの研究で、ガラス形成液体の動的不均一性を定量化するのによく用いられているノンガウシアンパ ラメーター(NGP)を解析し、直鎖と環とで比較することで動的不均一性における形状の効果を調査し、高分子鎖間の相互作用がNGPによって特徴づけられることを明らかにした。本研究では、鎖の硬さ・系 の数密度を変化させることで、環状鎖の慣性半径がNGPの振る舞いに大きく影響していることを示した。

Molecular dynamics simulation of Cu-Cu solid-state bonding for electronics packaging

Author: Hiroaki TATSUMI 
Affiliation: Joining and Welding Research Institute, Osaka University

先端半導体デバイスの接合において、はんだ付に代わる精密接合技術としてCu-Cu固相接合が検討されている。本研究では、上記技術における原子スケールでの接合機構の解明を目的とした。本研究では、接合される二つの面の結晶方位関係が、接合挙動に及ぼす影響について分子動力学シミュレーションにより評価した。その結果、両接合面の結晶方位が異なる場合において、急速な接合の進展が生じる可能性が示唆された。このことは、接合初期に形成される粒界構造の不安定さに起因することが推定された。

Numerical simulations in particle and nuclear physics

Author: Hiroaki Kouno 
Affiliation: Saga University

主に格子QCD等の計算とそれに関連する計算を行った。配位を生成し、物理量を計算した。アイソスピン化学ポテンシャル存在する場合の計算も行った。
得られたデータについてパーシステントホモロジーを使った解析(トポロジカル・データ解析)を行った。

Numerical simulations of water environment in lakes, basins, rivers, and estuaries

Author: Nakatani Yusuke¹ Kashima Chihiro¹ Kakehi Kota¹ Yamane Naruhiro¹ Deguchi Hiroshi¹ Tsuruta Shu² Kadowaki Daisuke² 
Affiliation: Division of Global architecture, Graduate school of Engineering, Osaka University¹ Division of Global architecture, School of Engineering, Osaka University²

流動水質モデルおよび流域水文水質モデルを用いて,各種水域の流動・水質・物質輸送の数値シミュレーションを行った.

Simulation of electronic structure in topological insulators

Author: Ryu Yukawa 
Affiliation: Graduate School of Engineering, Osaka University

トポロジカル絶縁体表面には高移動度の金属層が形成される。その電荷密度分布が外部摂動により変化する様子を明らかにするため、密度汎関数理論に基づく大規模計算を実施した。2×2×6 quintuple layerのトポロジカル絶縁体を真空層で挟んだスラブ構造を用いて計算を行った。その結果、表面から1 nm以上深くまで表面状態の電荷密度が分布していることが確認された。さらに、外部摂動でその分布が大きく変わる様子を捉えた。本結果は外部摂動により表面状態スイッチングが可能であることを示唆している。

Interaction energies between PIN1 protein and different ligands

Author: Eunice Gwee 
Affiliation: Hokkaido University

Utilised the Fragment Molecular Orbital method (FMO) as a cost saving approach to study interaction energies between different ligands and the active site of PIN1 protein. FMO, paired with the parallelization between CPUs, enabled us to better understand the interactions between ligands and the active site of PIN1 protein.

Creation of Organic Diradicals and Development of Their Functions

Author: Akihiro Shimizu 
Affiliation: Graduate School of Engineering Science, Osaka University

炭化水素を基盤とする様々な新規有機ジラジカルを設計し、一重項状態と三重項状態のエネルギー差を比較することにより、分子内および分子間の磁気的相互作用の大きさを見積もった。また、スピン密度を解析することにより反応点を予測し、単離するためのかさ高い置換基を導入する位置を決定した。

Designing of Composite Materials by Using Computational Science

Author: Takahiro Yamasaki, Hiroyuki Ogiwara, Hiroyoshi Momida, Takumi Akada 
Affiliation: SEI Joint Research Chair for Materials Design, Graduate School of Engineering, Osaka University

第一原理計算プログラムを用いて界面を含む構造のエネルギー計算を行い、それらの結果を教師データとしたニューラルネットワークポテンシャル(NNP)を作成し、より大規模な古典分子動力学計算を行うという一連の手順を確立した。第一原理計算プログラムはPHASE/0(2022.01)を用い、NNP作成にはDeePMD-Kitを、古典分子動力学計算にはLAMMPS(+DeePMD)を使った。原子種が3種を超える場合に教師データの不足により古典分子動力学法計算が破綻するなどの事象が発生した。教師データを適切に補うための知見を積み重ねている。また、鉄鋼材料中の母相に対する析出物の整合性(3種の界面構造モデル)の第一原理計算プログラムによる評価を試みたが、1,000原子規模では歪のたまらない構造を作るのに充分でない、初期界面構造モデルが適切でないと界面で激しい原子拡散が生じるなど、いくつかの課題が明かになった。

Lattice simulation of entanglement negativity for finite temperature QCD

Author: Yukinao Akamatsu ,Masayuki Asakawa 
Affiliation: Osaka University

有限温度QCDの量子状態の量子相関を調べるために、混合状態のエンタングルメント指標であるネガティビティをレプリカ法により経路積分で評価する計画であったが、2022年度は主に計算の実行可能性について検討するに留まった。

Three-dimensional simulation on ultrahigh-energy particle acceleration driven by megatesla magnetic reconnection

Author: Masakatsu Murakami 
Affiliation: Institute of Laser Engineering, Osaka University

  Authors:Masakatsu Murakami Affiliation:Institute of Laser Engineering, Osaka University Abstract:It is a project adopted for Research Proposal Based Use in FY 2022.  

Enhancer detection at the single-cell level using the deep learning method

Author: Ken Murakami 
Affiliation: Laboratory for Cell Systems, Institute for Protein Research, Osaka University

組織は多種多様な細胞が環境に応答し、それぞれ異なる遺伝子発現を示すことによって機能している。そのためにはエンハンサーとよばれる遺伝子発現の制御領域が細胞ごとに異なる活動を示す必要がある。しかし現在の手法ではエンハンサー領域を一細胞レベルで同定することは不可能である。そこで深層学習手法とシングルセルデータから一細胞レベルでエンハンサー領域を決定する手法を開発する。まず遺伝子近傍のシングルセルATAC-seqデータから遺伝子発現を予測するニューラルネットワークを構築し、その後、予測結果に大きく影響を与えるATACピーク領域を解析し、エンハンサーとして決定した。結果としては、遺伝子発現をATAC-seqデータから予測しやすい遺伝子と予測しにくい遺伝子が存在し、予測しやすい遺伝子は細胞種特異的な機能をもち、しにくい遺伝子はハウスキーピング遺伝子が多いことがわかった。エンハンサーの決定能を公開データを用いて検証したところ既存の手法より高いF1スコアを示した。

Super accurate quantum mechanical calculations of atoms and molecules with the local Schrödinger equation method

Author: Hiroyuki Nakashima 
Affiliation: Division 4, Quantum Chemistry Research Institute

本研究は、原子・分子のシュレーディンガー方程式の正確な一般解法として提案された自由完員関数理論と局所シュレーディンガー方程式法によって、化学反応に重要なポテンシャル曲面を精密に計算する方法を発展させた。強い静的電子相関を持ち量子化学の理論検証のベンチマークとして用いられるH4分子への応用では、シュレーディンガー方程式の絶対解として正確な化学精度を満足するポテンシャル曲面の計算に成功し、従来法よりも遥かに高精度な結果を得ることができた。

The Elucidation of Non-equilibrium States of Heterogenous Catalysis by Data-driven Multiscale Simulation: A Case Study of Methanol Synthesis

Author: Harry Handoko Halim, Ryo Ueda, Yuki Yamada 
Affiliation: Graduate School of Engineering, Osaka University

Global warming is world class problem that becomes more worrying over the years. A promising solution comes from the conversion of CO2 (i.e., greenhouse gas) to higher-value chemical such as methanol which can be achieved by heterogenous catalysis. The advantage of this conversion is two-fold: reducing the amount of CO2 in atmosphere and producing methanol which can be used to generate electricity through fuel cell. Understanding the non-equilibrium states (i.e., states when transformation occurs) of catalytic process of methanol synthesis is the key factor in designing the best catalyst. However, observing the non-equilibrium states is inaccessible in most experiments due to the atomistic size and time scale of the events. Though computational approach such as molecular dynamics (MD) can observe detail atomistic events, it suffers from huge tradeoff between speed and accuracy.
In the emergence of data science, it is possible to accelerate the MD simulation while maintaining high accuracy of Density Functional Theory (DFT) level. This can be achieved by machine-learning the energy and forces of atomic structures defined in a set of DFT data. Armed with this framework, we conducted direct observation of non-equilibrium states of initial stage of methanol synthesis including the three main reactants: CO2, CO, and H2 gases. In all cases, we interacted the molecular reactant with Cu surface and directly observe the non-equilibrium events, resulting in the following findings.
(i) CO induces the formation of active Cu clusters on Cu stepped surface by increasing frequency of single adatom detachments from step edge.
(ii) The successful hydrogenation of CO2 is affected by the initial conditions of the gas such as vibrational modes, vibrational energy, incident angle, and incident target. The best conditions leading to the successful hydrogenation is tabulated.
(iii) The accurate modelling of Cu nanoparticle interaction with hydrogen gases is ongoing.

Development of NTChem, a Quantum Chemistry Software

Author: Eisuke Kawashima¹ William Dawson¹ Stanislav Kedžuch¹ Subodh Sudhir Khire¹ Shota Tsuru¹ Muneaki Kamiya²  
Affiliation: RIKEN Center for Computational Science¹ Faculty of Regional Studies, Gifu University²

当研究チームで開発している量子化学計算ソフトウェアNTChemについて,adaptive density partitioning technique実装が,効率的に高速Fourier変換を実行しているかについて評価した.系は水素終端されたシリコンSi17H36で,計算レベルはPBE/3-21Gである.3-21Gを採用したのは,大きな基底関数系では実空間での通常の2電子積分がボトルネックとなるためである.Intel MKL (FFTWのラッパ) にリンクしたNTChemのベンチマークの結果,良好なパフォーマンスが発揮されていることを確認した.

Computational materials design of Huesler alloys based on first-principles calculations

Author: Kazunori Sato 
Affiliation: Osaka University

第一原理計算によりホイスラー合金系の電子状態を計算し、機能材料のマテリアルデザインを行うことを目的とし、FLAPW法によるバンド計算コードHiLAPWを用いて、ホイスラー合金の電子状態を網羅的に計算した。計算で得られる電子状態密度をもとに系の安定性などを調査し、元素の組み合わせを変えることで第一原理計算結果のデータベースを作成した。

Supersonic combustion due to the interaction between streamwise vortices and two oblique shock waves using separation-restraint (SR) struts

Author: Toshihiko Hiejima 
Affiliation: Department of Aerospace Engineering, Osaka Metropolitan University

マッハ3.5の超音速流中で SRストラットが作り出す縦渦と二つの交差する斜め衝撃波が,ストラット後縁から噴射される燃料水素とどのように反応し,短距離で超音速燃焼が実現できるのかを数値計算で調べた。

Numerical Simulation on Reaction and Transport Processes in Large-scale Porous Media

Author: Shohji TSUSHIMA 
Affiliation: Department of Mechanical Engineering, Graduate School of Engineering

多孔質内に充填された液相の蒸発挙動の解明のために二相格子ボルツマン法に蒸発を誘導する計算手法を導入して妥当性の検証を行った.その上で複雑な多孔質系へと適用し,蒸発挙動について基礎的な検討を実施した.

Development of a high performance CFD tool for offshore wind farm flows

Author: Seiya Watanabe 
Affiliation: Research Institute for Applied Mechanics, Kyushu University

本研究課題は,大規模計算に適した格子ボルツマン法による流体計算とGPUを利用し,洋上ウィンドファームの発電量と風況を高精度に予測可能なCFDツールの開発を目的とする.風車は簡易的にActuator Lineでモデル化し,洋上の風況はTurbSimというソフトウェアを利用して作成する.開発ツールの検証とし,80基の2MW風車から構成されるデンマークの洋上ウィンドファームHorns Rev 1に対し,2m解像度・32億格子を用いた計算を4ノード32GPUで実施した.各風車の発電量を先行研究の観測データと比較し,開発したCFDツールは前方風車のウェイクの影響による後続風車の発電量低下を再現できることを確認した.12000秒のシミュレーション時間・1600000タイムステップの長時間の解析を実施し,ウィンドファームのウェイクの乱流強度などの統計量を評価した.

Studies of classical and quantum many-body problems: tensor network approach

Author: Yasuhiro Akutsu 
Affiliation: Graduate School of Science, Osaka University

高次特異値分解を用いたテンソル縮約法(HOTRG)や密度行列くりこみ群(DMRG)を用いて2次元・3次元多体問題の解析を行った。特に、2次元HOTRGにおける特異値分布とDMRGの密度行列固有値分布間の一般的関係に基づき考案した、対象系の非臨界性判定法を2層ダイマー模型に適用し、この系が層間相互作用の強さによらず非臨界的であることを示唆する結果を得た。

Sliding Dynamics of Ring on Polymer in Polyrotaxane

Author: Koichi Mayumi 
Affiliation: The institute for sqlid state physics, The University of Tokyo

  Authors:Koichi Mayumi Affiliation:The institute for sqlid state physics, The University of Tokyo Abstract:It is a project adopted for Research Proposal Based Use in FY 2022.  

Laser micro machining using a photonic nanojet

Author: Tsutomu Uenohara 
Affiliation: Department of Mechanical Engineering, Osaka university

フォトニックナノジェット(Photonic nanojet: PNJ)は誘電体マイクロ球にレーザを照射することで発生するビームである.PNJの高分解能な強度分布制御によって,高分解能に加工幅や加工深さを制御可能なレーザ微細加工技術の確立を目的とする.PNJを用いたレーザ加工の自由度向上のために,マイクロ球へのレーザ照射条件を検討した.Finite-Difference Time-Domain法による電磁場解析を行い,集光ビームの伝搬特性を利用したPNJの姿勢制御方法を新たに提案し,加工実験によりその有用性を実証した.

Molecular Dynamic Research of the Energy dissipation during Plastic Deformation

Author: Xiang LI 
Affiliation: Graduate School of Engineering, Osaka University

To provide a precise prediction of Taylor-Quinney coefficient (TQC), which is the friction of the conversion of external deformation work to heat during plastic deformation, molecular dynamic simulations of plastic deformation were performed. We constructed single-crystal atomic models of pure metals (Fe, Al, Ni, Cu, Ag, Mg) with various crystal structures (BCC, FCC, HCP), on which simple shear strain was applied at a constant, extremely high shear strain rate. A new numerical model of the calculation of TQC using the energy stored in crystal defects during the deformation was suggested and was used to calculate the TQCs during the simulation. The correlation of TQC with stacking fault energy (SFE) was also discussed. As a result, the curves and predicted values of TQC were obtained in agreement with existing numerical models and experimental data. TQC also showed a dependence on crystal orientation and SFE.

Chemical ordering effect on the radiation resistance of a CoNiCrFeMn high-entropy alloy

Author: Yangen Li , Yujie Jia, Shihao Zhu, Yuta Ebi, Taisei Sugiyama, Takashi Yajima, Heting Liao, Hossan Rana, Yuji Sato, Shuhei Shinzato, Shigenobu Ogata 
Affiliation: Osaka University

The chemical ordering of CoNiCrFeMn and its effect on radiation resistance is analysed in this study via Monte Carlo (MC) annealing simulation and molecular dynamics (MD) radiation damage simulation. MC annealing at a lower temperature of 600 K forms an initial stage Cr-rich region in CoNiCrFeMn due to a strong chemical ordering-driven phase decomposition, whereas, annealing at a higher temperature of 1100 K forms a chemical short-range order (CSRO). MD radiation damage simulation shows that the Cr-rich region formed by 600 K annealing accelerates the aggregation and the evolution of defects, facilitating more dislocation loops formation. On the other hand, the CSRO structure formed by 1100 K annealing effectively delays the growth of defect number and tends to reduce the dislocation density and defect diffusion, suggesting better radiation resistance. However, the CSRO structure is destroyed by radiation, thus these advantages of CSRO will disappear in due time if CSRO cannot heal. Fortunately, since the CSRO can recover at working temperature of 1100 K, we speculate that under the working temperature of 1100 K and with a modest radiation damage rate, the advantages of CSRO can maintain for a long time. We finally discuss the condition of the CSRO preservation by proposing a CSRO radiation damage – diffusion healing competition model.

FNO for vehicle bridge interaction system and damage prediction

Author: Chul-Woo KIM 
Affiliation: Dept. of Civil & Earth Resources Eng., Graduate School of Eng., Kyoto University

目的:
•Propose FNO (Fourier Neural Operator) to learn mappings between damage field and structural responses, which only utilize data from a bridge at the healthy state to predict the bridge at the damaged state, and
•Examine VINO numerically and experimentally in structural simulation and SHM.
内容:
•Establish Vehicle-Bridge Interaction (VBI) numerical and experimental dataset,
•Train and test the FNO by numerical data,
•Fine-tune by experimental healthy data, and validate by experimental damage data.
結果:
•Forward FNO for prediction of structural responses was more accurate and faster than FEA (Finite Element Analysis) once it is trained, and
•Inverse FNO for damage prediction could determine, localize, and quantify damages from structural responses.

Development of data-driven cavitation model using CFD database of cavitating turbulent flow

Author: Kie Okabayashi 
Affiliation: Graduate School of Engineering, Osaka University

  Authors:Kie Okabayashi Affiliation:Graduate School of Engineering, Osaka University Abstract:It is a project adopted for Research Proposal Based Use in FY 2022.  

Numerical Simulation on Mixing Control of Free Jet

Author: Koichi Tsujimoto 
Affiliation: Division of Mechanical Engineering, Graduate School of Engineering, Mie University

DNS(Direct Numerical Simulation)により,傾斜回転と脈動による衝突噴流の制御を行い,衝突距離と周波数比(=脈動周波数/回転〃)が伝熱特性に与える影響を明らかにした.傾斜角度を時間変化させた回転衝突噴流の制御を行い,回転周波数と傾斜角度の変動周波数(傾斜周波数)が同じ場合,領域中央部の伝熱が増加し,傾斜周波数が大きい場合,領域外縁部の伝熱が向上することを明らかにした.壁面が振動制御された複数の衝突噴流では,振動周波数や振動振幅が大きいときは伝熱の一様性が高くなることを明らかにした.平面液体自由噴流における噴流と周囲流体の密度比が噴流の拡散に及ぼす影響を明らかにした.

Numerical Simulations for Elucidating Turbulent Transport Phenomena

Author: Yutaro Motoori 
Affiliation: Graduate School of Engineering Science, Osaka University

本研究では,乱流がどのように粒子を輸送するのか,一方,粒子は乱流をどのように変調させるのかを解明するために,数値シミュレーションを実行した.

Systematic understanding of the structure-function relationship of droplet transport and collection driven by surface wettability patterning in fractal open microfluidic channels

Author: Hiroyuki Kai 
Affiliation: Tokyo University of Science

  Authors:Hiroyuki Kai Affiliation:Tokyo University of Science Abstract:It is a project adopted for Research Proposal Based Use in FY 2022.  

Realization of DNS of turbulent viscoplastic fluid flow and observation of the turbulent structure

Author: Takashi Ohta 
Affiliation: University of Fukui

粘塑性流体乱流のLESモデルを構築するための基礎的研究として,Herschel-Bulkleyモデルを用いて粘塑性流体のDNSを実行した.そして,乱流統計量と瞬時構造をニュートン流体の場合と比較することで,粘塑性流体の発達した壁乱流の特徴を明らかにした.また,流体の降伏応力の変化による乱流構造の変化にも注目した.特に,乱流統計量の観点から,速度ストリークや縦渦といった乱流構造の変化を定量的に調べた.さらに,流れの状況により変化する粘度を考慮した空間スケールの正規化を粘塑性流体乱流の予測結果に適用し,渦度変動強度や速度変動強度の壁からの距離,平均ストリーク間隔をニュートン流体の場合と比較し,その正規化の有用性を確かめた.以上のことから,粘塑性流体乱流の乱流構造の空間的特徴をニュートン流体の場合と同じように表現できる空間スケーリングの方法は,乱流構造に基づいた乱流制御の実現のために必要な知見になることがわかった.

Detailed design of BNCT-SPECT considering coincidence counting between detection elements

Author: Mikito Yagura 
Affiliation: Quantum Reaction Engineering

BNCTの治療効果をリアルタイム計測するBNCT-SPECT装置において、治療場に存在しうる全ての放射線を考慮したシミュレーションを行い、非同時計数法と同時計数法によるノイズ低減の効果とBNCT-SPECT装置の性能を正確に評価することを目的に研究を行った。PHITS(Particle and Heavy Ion Transport code System)を用いて、頭部に中性子ビームを照射し、検出器中心位置での中性子・γ線フラックスを求める計算をはじめ、各計算で多大な時間がかかることが予想されたため、「SQUID」を使用した。
結果として、計算時間が研究室で使用しているPCの使用時に2〜4週間かかる計算を1日以内に短縮することができた。計算短縮のおかげで、BNCT-SPECT装置の性能を正確に評価することができた。

Viscosity and elementary excitations in molecular liquids

Author: Iwashita, Takuya 
Affiliation: Department of Science and Technology, Oita University

本研究の目的は,高温液体の粘度と局所構造緩和の関係性を明らかにすることである。先行研究において液体金属の粘度と構造緩和時間の関係性を特徴付けることに成功したため,本研究では,より複雑な低分子量の分子性液体までその考え方を拡張し,その適用可能性について調べた.結果,粘度の源である応力の時間相関関数は,高温状態でさえ振動モードと緩和モードに分離でき,その緩和モードが局所構造緩和と関連していることを見出した。

Lattice Boltzmann Simulation on Reaction and Transport Processes in Porous Media and its applictions for Large-scale Simulation

Author: Shohji TSUSHIMA 
Affiliation: Department of Mechanical Engineering, Graduate School of Engineering

格子ボルツマン法による電気化学反応輸送解析手法を多孔質電極に適用し,随伴変数法を用いた最適化手法についての定式化ならびに実装を行い,GPU化に向けた改良を実施した.

Analysis of Intermolecular Interactions in Organic Molecular Crystals

Author: Ryusei OKETANI 
Affiliation: Division of Chemistry, Graduate School of Engineering Science, Osaka University

弱い分子間相互作用が支配的に働く有機分子性結晶中における分子間相互作用エネルギーを量子化学計算によって見積もり、その結晶構造を与える要因を探る。本年度の主な結果として、複数の成分が不定比で混ざり合う水素結合性有機フレームワークにおいて、成分間の分子間相互作用が非常に似ていることを明らかにした。

Basic Study of Spectrally Efficient Frequency Division Multiplexing

Author: Kazuki Komatsu 
Affiliation: Dept. Electrical and Electronic Information Engineering, Toyohashi University of Technology (Until 2023/1/31)Wireless Systems Laboratory, Wireless Networks Research Center, Network Research Institute, National Institute of Information and Communications Technology

スペクトル有効周波数分割多重方式(SEFDM: Spectrally Efficient Frequency Division Multiplexing)は,現在主流の直交周波数分割多重方式に比べて必要な周波数帯域幅を圧縮することができ,周波数利用効率に優れている.
しかし,特に多数のサブキャリアを有するSEFDMにおいて,有効な復調法は未だに開発されていない.
本研究では,大規模SEFDMにおいて優れたビット誤り率を達成するための変調方式と復調方式について研究する.

Numerical study on the interaction between large-amplitude electromagnetic waves and high-density plasmas under a strong magnetic field

Author: Takayoshi Sano 
Affiliation: Institute of Laser Engineering, Osaka University

高速電波バースト(FRB)と呼ばれる天体現象では、ミリ秒程度の短い持続時間の高輝度電波放射が観測されている。この天体の放射源及び放射機構については未解明であるが、マグネターと呼ばれる強磁場磁気圏を持つ中性子星との関連が指摘されている。そこで、我々はFRB で予想されるような極限プラズマ下での波動粒子相互作用をPIC シミュレーションを用いて解析している。

Study on the numerical measurement method of turbulent premixed flames using DNS data

Author: TSUBOI Kazuya 
Affiliation: Okayama University

内燃機関の更なる高効率燃焼のためには内燃機関内の乱流火炎を高精度に計測してその構造やメカニズムを明らかにする必要がある.利用者は最近,直接数値シミュレーション(Direct Numerical Simulation: DNS)で厳密に計算された実際の火炎と同等な取り扱いが可能な乱流火炎データベースに対して,計算機上で光学計測と同様な計測を行う数値計測を創成し,その手法を確立した.本研究では,内燃機関における乱流火炎の光学計測の高精度化を目的とする.
計測精度に影響を及ぼすと考えられる乱流予混合火炎面(等温面)と流速の関係について,数値計測により検討した.
火炎面(等温面)近傍の主流方向流速分布において,流速0m/sの等値面は等温面に沿って変化している.このことから等温面と流れとの間の関係性が確認された.

Deep Learning based radiomics analysis using lung CT datasets and radiology reports

Author: Junya Sato 
Affiliation: Graduate School of Medicine, Osaka University

  Authors:Junya Sato Affiliation:Graduate School of Medicine, Osaka University Abstract:It is a project adopted for Research Proposal Based Use in FY 2022.  

Direct Numerical Simulations of Turbulent Flows and Multi-phase Flows

Author: Takahiro TSUKAHARA¹ Tomohiro NIMURA² Kazuki KOHYAMA² Kousuke NAKAGAWA² Junnosuke HIRAGA² Rio HOSOI² Yuki MATSUKAWA² Masaya TASHIRO² Toshiyuki KURIHARA² Takumi TAKAHASHI² Shunsuke SOMEYA² Shotaro OKAZAKI² Yu OTA² Soki SHINKAI² Kota KIKUCHI¹ Shusaku KAKIUCHI¹ 
Affiliation: Department of Mechanical Engineering, Tokyo University of Science¹ Department of Mechanical Engineering, Tokyo University of Science²

壁面せん断流の亜臨界乱流遷移現象における準秩序構造や遷移過程などの解明のため,本研究では各種クエット流や後退翼平板境界層などの直接数値シミュレーション(DNS)を行った.また,スカラー物質乱流拡散や粘弾性流体壁乱流に対する機械学習の適用可能性を,DNSデータに基づいて調査した.OCTOPUS環境下では,OpenFOAMによる二自由表面液膜の温度差マランゴニ対流などの解析も実施した.

Quantum chemistry calculations for application to MI

Author: Yamamoto Keita, Yoshiyasu Hayato, Motomura Hajime, Kinoshita Shunto 
Affiliation: Nippon Shokubai Research Alliance Laboratories, Graduate School of Engineering, Osaka University

機械学習を用いて材料開発を行うマテリアルズ・インフォマティクス(MI)においてデータの質と量が重要となる。本テーマでは量子化学計算を利用したMIについて検討を行った。具体的な計算内容としては仮想的に発生させたアクリル酸誘導体モノマー構造をもとにGaussian16を用いて構造最適化、エネルギー計算を行った。また、得られたデータを用いて主成分分析を行った。試薬ベンダー3社のHP上に記載されている構造情報をもとに行った計算結果と比較したところ、アクリル酸誘導体の主成分の広がりの方が小さいことが分かった。尚、約2万件の構造最適化計算におおよそ3.2万ノード時間を消費した。

Investigation of optical activity of helicene molecules by TERS and DFT.

Author: Takuma Hattori  
Affiliation: Osaka University

探針増強ラマン散乱は、ナノスケールという高い空間分解能で分子のラマンスペクトルを取得できる手法である。一方で、単分子レベルであるがゆえに、空間平均されたラマンスペクトルとは異なり、分子の配向によってスペクトル形状が異なる。そのため、配向に依存したスペクトルを計算し、実験データと比較した。OCTOPUS内のgaussian16を用いて、実験で用いているヘリセン分子のラマンスペクトルをDFTで計算した。配向を考慮すると、実験結果とよく一致することがわかった。また、現在ROAスペクトルを実験的に取得することを試みており、DFT計算結果を取得した。

Convection visualization in boiling heat transfer using direct numerical simulations.

Author: Tomohide Yabuki¹, Yohei Sato², Kenta Hatanaka¹, Ryuki Shono¹ 
Affiliation: Kyushu Institute of Technology.¹,Paul Scherrer Institute²

沸騰熱伝達における壁面の対流熱伝達機構を調べるために,二相流CFDソルバーであるPSI-BOILを用いて水の飽和プール沸騰を数値シミュレーションした.結果として実験同様に対流熱伝達が壁面熱輸送の大部分を担っていることが示された.今後,本計算で得られた熱流動場,壁面熱伝達率を解析することで,対流熱伝達機構を詳細に調べていく.

Evaluating dielectric properties of polymeric materials by MD simulation

Author: Koki KITAI 
Affiliation: Faculty of Engineering, The University of Tokyo

本研究者のグループでは、平衡分子動力学(平衡MD)計算によって高分子材料の複素誘電率および線膨張係数等の物性を評価する一定の手順を設定した。本研究ではその方法を多数の分子に対して適用し、まとまったデータを取得することを目的とした。MD計算にはMPI並列の効率が良いCPUノード群を用い、2022年度において500種類を超えるホモポリマー材料について計算を完了した。また得られたデータに特徴量選択手法を適用し、目的物性のためのスクリーニングに有用と考えられる分子構造に関する特徴量を抽出した。今後、これらの成果をまとめて発表を行う見込みである。

Radiation Hydrodynamic Simulation Study on Laser-Processing Technology and Production of materials and energy

Author: Yoshitaka Mori¹ Atsushi Sunahara² 
Affiliation: Graduate School for the Creation of New Photonics Industries¹ Purdue University²

我々の研究目的は多次元輻射流体数値シミュレーションを駆使し、レーザー駆動超高圧を利用したレーザー加工プロセス、新物質創生、及びレーザー核融合エネルギー創生に関わるレーザープラズマ相互作用の学理を明らかにすることである。本年度、2次元輻射流体シミュレーションを大幅に改良し、空間2次精度に向上させるととともに二温度化収束精度を向上させた。金属スズにレーザーを照射する条件で計算を行ったところ、レーザースポット周りのプラズマ分布で大きな計算結果の違いが求められた。速度の空間精度向上によると考えられる。

Numerical simulation and machine learning of turbulent and multiphase flows

Author: Shintaro Takeuchi and Kie Okabayashi 
Affiliation: Dept. Mechanical Engineering, Osaka University

乱流,気泡や粒子などを含む二相流,伝熱,潤滑,流体-構造連成解析,界面現象などを対象として,数理モデルの開発,解析手法の高度化・高精度化,現象の解明,データ駆動型モデルの開発を目指している.

DFT simulation for Si etching using Pt catalyst and pure water

Author: Daisetsu Toh 
Affiliation: Osaka university, Department of Precision Engineering

(目的) 純水とPtを使用したSi(100)のエッチング機構の解明
(内容) 申請者は純水中でPtとSiを接触させ相互に運動させることでエッチングが進行し,ステップテラス構造を持つ原子レベルの平滑面を取得している.さらに本エッチング反応は液中の溶存酸素を抜いた脱気水中でも進行することを見出し,従来報告されている金属アシストエッチングとは別物であることが示唆された.そこで申請者は本反応がPt上での水分子の解離吸着(IS1→IS2)・生成されたOH基によるステップ端Si原子の過配位構造の形成(MS)・Siのバックボンドの切断(FS)からなる間接的な加水分解反応であると仮定し,本反応におけるエネルギー障壁の算出を実施した.
(結果) IS1(レプリカNo.1),IS2 (レプリカNo.2) ,MS (レプリカNo.3) ,FS (レプリカNo.12)のトータルエネルギーはIS1を基準とするとそれぞれ,0eV,0.42 eV,0.10 eV,0.16eVとなった.またMS→FSにおけるエネルギー障壁高さは0.84 eVとなりバックボンドの切断は室温でも十分に進行するといえ申請者の想定した反応が実系でも進行することが示唆された.今後IS1→IS2,IS2→MSにおけるエネルギー障壁の算出を進める.

Deep-Learning-Based Discovery of Super-Composite Electrical Insulating Materials

Author: Hajime Shimakawa 
Affiliation: School of Engineering, The University of Tokyo

  Authors:Hajime Shimakawa Affiliation:School of Engineering, The University of Tokyo Abstract:It is a project adopted for Research Proposal Based Use in FY 2022.  

Appearance of the Hoyle state and its breathing mode in 12C despite strong short-range repulsion of the nucleon-nucleon potential

Author: Hiroki Takemoto 
Affiliation: Faculty of Pharmacy, Osaka Medical and Pharmaceutical University

現実的核力として Argonne v_18 ポテンシャルを中心力のみで表現した Argonne v_4^’(AV4P)ポテンシャルを用い、12C原子核の低励起 0^+ 状態に関する理論計算を行った。AV4P が持つ強い斥力芯による相関は Unitary Correlation Operator Method により処理し、変分波動関数として Bloch-Brink 波動関数を用いた。スーパーコンピュータを用い、Generator Coordinate method により低励起状態の同定を行った結果、観測されている4つの低励起 0^+ 状態を同定することができた。これらの状態と α 凝縮状態を記述する Tohsaki-Horiuchi-Schuck-Röpke 波動関数との比較から 0_2^+ がα 凝縮状態であること、0_3^+ が 0_2^+ のBreathing mode であることが確認できた。

Improvements of a Tsunami Inundation Simulation

Author: Akihiro Musa 
Affiliation: Cyberscience Center, Tohoku University

目的: 津波浸水被害予測シミュレーションのクラウドバースティング環境における有効性の評価を行う.
内容: 本シミュレーションは,大規模地震発生時にリアルタイムに津波被害予測を行うために開発されたものである.そのため,現在利用しているSQUIDシステムが混雑している場合にも本シミュレーションをいち早く動作させる必要がある.ここで,有効と考えられる手段としてクラウドバースティングがある.本研究では,クラウドバースティングを用いてSQUIDシステムからMicrosoft Azureへ本シミュレーションを転送・実行し,その有効性の評価を実施した.
結果: 評価にはOCTOPUS,SQUID(汎用CPUノード群),Microsoft Azureのそれぞれ1ノードを用いた.評価では実行時間とコストを比較した.その結果,Azureの実行時間はOCTOPUSの1.7倍とSQUIDの2.4倍であった.また,コストはOCTOPUSの85倍とSQUIDの41倍でもあった.被害予測はより短時間で行う必要があり,本評価によって今後クラウドバースティングを考慮した高速化が必要であることが判明した.

Resonance phenomena in light nuclei

Author: Takayuki Myo 
Affiliation: Faculty of Engineering, Osaka Institute of Technology

1)中性子過剰He同位体、及びミラー核である陽子過剰核における共鳴状態を理論的に調べた。特に過剰な中性子群/陽子群が原子核中で集団的に振動する新奇な共鳴状態を予言し、その状態が遷移強度関数に与える影響を示した。
2)共鳴状態の期待値は一般的に複素数となり、その解釈は未解決であった。本研究ではグリーン関数を用いることで、共鳴状態の複素期待値をエネルギーに関する強度関数に変換できることを定式化した。具体的に半径の期待値へ適用し、強度関数の形状を議論した。

Development of quantum software and its application to many-body problems

Author: Hiroshi Ueda, Miyakoshi Shohei 
Affiliation: QIQB

近年、量子計算機の自由度を活かした量子多体系のシミュレーションが注目を集めている。特に現在の量子計算機の事情とマッチした浅い量子回路で適切な量子状態を表現する手続きの構築が重要となっている。このような背景のもと、縦磁場と横磁場が共存する量子Ising模型における強磁性状態の時間発展ダイナミクスのシミュレーションを対象に、非平衡状態に対する最適な量子回路表現を探究した。任意の量子状態を表現するマルチ量子ビットゲートによる行列積状態の構造を起点として、それらを少数の2量子ビットゲートに分割した際に自然と得られるダイアモンド型の量子回路表現についてシミュレーションを行なった。その結果、ダイアモンド型の量子回路を用いたシミュレーションでは同数のゲートを持つ他の量子回路アンザッツと比較してより長いシミュレーション時間を再現することがわかった。

The Elucidation of Non-equilibrium States of Heterogenous Catalysis by Data-driven Multiscale Simulation: A Case Study of Methanol Synthesis

Author: Halim H Harry ; Ueda Ryo ; Yamada Yuki 
Affiliation: Graduate School of Engineering, Osaka University

  氏名:Halim H Harry ; Ueda Ryo ; Yamada Yuki 所属:Graduate School of Engineering, Osaka University 概要:It is a project adopted for Research Proposal Based Use in FY 2022.  

Development of brain information analysis technology

Author: Yu Takagi, Shinji Nishimoto, Koide Naoko, Takuya Matsuyama 
Affiliation: Graduate School of Frontier Biosciences Osaka University

ディープラーニング技術の内部表現と、fMRIを用いて計測されたヒト脳活動との相同性を検証した。
fMRIデータとディープラーニング技術の内部表現に対して、エンコーディングモデルおよびデコーディングモデルを適用することによってそれらの相同性を包括的に検証した結果、ディープラーニング特徴量が各レイヤーごとに異なる形で脳活動の異なる部位と対応していることがわかった。また、ディープラーニング特徴量を活用することで脳活動からのデコーディング精度が向上することがわかった。

Nuclear density functional theory for a systematic investigation of collective motions in exotic nuclei: toward s a microscopic description of structures of neutron drip line nuclei and superheavy nuclei

Author: Kenichi Yoshida 
Affiliation: Graduate School of Science, Kyoto University

  Authors:Kenichi Yoshida Affiliation:Graduate School of Science, Kyoto University Abstract:It is a project adopted for Research Proposal Based Use in FY 2022.  

Developing an algorithm for comparing single-cell RNA-seq data

Author: Yuki Kato 
Affiliation: Graduate School of Medicine, Osaka University

シングルセルデータから導出される細胞集団の疑似時系列経路を比較することで、細胞の時間経過を制御する因子を同定できる可能性がある。ところが、従来は線形の経路同士でしか比較できず、分岐のある経路をグローバルに比較することができなかった。本研究では、木構造の疑似時系列経路を効率良く比較するツールCAPITALを開発した。人工データやヒト、マウスの骨髄細胞データを用いてCAPITALを評価した結果、他手法より高精度であり、実データにおける細胞型のペアを正しく対応させることに成功した。

Interfacial ionic liquids simulated by quantum chemical calculations and molecular dynamics simulations

Author: MATSUMOTO Yoshiaki, TARUI Shota, KAKINOKI Tomonori, HANAMORI Yu-ichiro, MOCHIDUKI Tatsuro 
Affiliation: Osaka University

電気化学において特に重要となる、電極とイオン液体の界面描像を分子レベルで明らかにするために、量子化学計算による電子状態計算と、分子動力学計算による分子挙動の解析を行った。結果、実験的に得られるイオン液体の紫外吸収スペクトルの帰属に成功するとともに、電極電位に応じた界面でのイオン液体の密度や配向を明らかにした。

Elucidating life-threading arrhythmias and establishing arrhythmia control methods

Author: Kunichika Tsumoto 
Affiliation: Kanazawa Medical University

心室性致死性不整脈を発症する際、きっかけとなる応答(トリガー応答)が発生することが知られている。本研究は、トリガー応答の生成メカニズムを明らかにし、不整脈誘発危険度を定量化することで、不整脈の発症予防・制御の方法論の開発を目的とする。ヒト心室筋細胞の数学モデルを元に、6 × 6 cmの心筋シートモデルを構成し、早期後脱分極(Early afterdepolarization: EAD)として知られる再分極異常を生じる心筋細胞群(クラスタ)を含む組織における興奮伝播ダイナミクスをコンピュータシミュレーションにより検討する。様々なEADクラスタ存在条件下でトリガー発生機序を検討した。心室組織内にEADクラスタサイズ、クラスタ間距離に依存した特定形状の再分極不均質性を示す組織領域が現れると、不整脈を惹起するトリガー応答が生成されることを見出した。

Activation energy of homogeneous nucleation of Zr hydride: Density functional theory calculation

Author: Akio Ishii 
Affiliation: Osaka University, Department of Mechanical Science and Bioengineering

Considering the nucleation process of Zr hydrides as phase transformation from hexagonal closed-packed (HCP) to face-centered tetragonal (FCT) structure, we calculated the activation energy of the homogeneous nucleation process of Zr hydrides and atomic rearrangement during nucleation for Zr4H, Zr2H, ZrH and ZrH2 using density functional theory calculations and minimum energy path detection. At 0 K limit, although ZrH and ZrH2 have lower chemical potentials and are more energetically stable than Zr4H and Zr2H, the latter have lower activation energies for nucleation. At finite temperatures, the crossover of activation energies occurs around 300 K, where ZrH becomes the most possible candidate with the lowest activation energy. This was explained by the difference in the atomic rearrangement and change in phonon frequency during phase transformation. Zirconium

Dynamic analysis of organic matter from the outer ocean in the Seto Inland Sea

Author: Yusuke Nakatani 
Affiliation: Graduate School of Engineering, Osaka University

  Authors:Yusuke Nakatani Affiliation:Graduate School of Engineering, Osaka University Abstract:It is a project adopted for Research Proposal Based Use in FY 2022.  

A Proposed Method for Evaluating Network Security Using Markov Chains and Network Centrality

Author: Shinya Mizuno 
Affiliation: Department of Computer Science, Faculty of Informatics, Shizuoka Institute of Science and Technology

組織におけるネットワークには,各種サーバ,クライアントPCやストレージなど様々な役割があり,コンピュータ同士が密接に繋がってネットワークが構成されている.本研究では,日々作り出されているネットワークログを用いて,コンピュータ間の通信状況を把握し集約する.そして,各コンピュータをマルコフ連鎖の状態として,コンピュータ間の通信における推移確率行列から,同値類の算出を行い,次数中心性を用いて,それぞれの同値類における中心的なコンピュータを算出する.同値類が多くなるほど,ネットワークはセグメント化されており,感染などの拡大は防ぎやすい.またマルコフ連鎖でシミュレーションを行うことで,どのくらいの単位時間で感染が拡大するかを得る.

FDTD Simulation of a Charged Airplane Model in an Ambient Electric Field with Triangular-prism Cells

Author: Shogo Okada 
Affiliation: Doshisha University Graduate School of Science and Technology

航空機が雷撃を受けるのは,雷雲下の電界により,機体端部に電荷が集まり,そこからリーダ放電が雷雲及び大地に向けて進展し始めるからである。逆極性電荷を発生させ,機体の電荷量を制御できれば,機体からのリーダの発生や進展を抑制することが原理的には可能である。本論文では,有限差分時間領域法(FDTD法)を用いて雷雲下の周囲電界及び45度の角度で傾いている航空機を模した。そして,航空機モデルの端部電界を解析した。航空機モデルが帯電していない場合,上端部の正電界が臨海破壊電界より高く,絶縁破壊が始まることが確認される。-200 nC帯電させた場合では,対応する臨界破壊電界よりも小さくなることが確認される。このことは,航空機に負の電荷を供給すれば,周囲電界における航空機のエッジ部や突起部の電界を緩和できることを示している。

Quantifying the impact of increased heavy rainfall due to climate change on the salinity field and physiological condition of cultured bivalves in semi-enclosed bay.

Author: Masahiro Nambu 
Affiliation: Division of Applied Biosciences, Graduate school of Agriculture, Kyoto University

気候変動によって日本では極端な降水が増加することが予測されており、沿岸域の低塩分化の強化や長期化によって、海洋生物に影響を及ぼすことが懸念される。本研究では閉鎖性海域である石川県七尾湾をモデル海域として、河川流量を降水量から推定する河川モデルとこれを反映させた海洋モデルを作成し、これに気候予測データセットに基づく将来降水量を入力することで、海域の塩分変化と、それに伴うマガキの生理状態への影響を定量化した.

Spatially heterogeneous RSB in layered p-spin models

Author: Yuki Rea Hamano¹ Hajime Yoshino² 
Affiliation: Department of Physics, Osaka University¹ Cybermedia Center, Osaka University²

Spatially heterogenous replica symmetry breaking (RSB) is a phenomenon in complex systems that has only been observed before in multilayer Perceptrons [1, 2]. There is however no reason that it should be unique to Perceptrons. Our aim in this research is to explore and characterize the properties of spatially heterogeneous RSB in simpler, canonical models of complex systems. To this end we study a generalized minimalistic model of quasi-1-dimensional spin glasses (SG) – the layered p-spin model – using replica theory. We focus on the simplest non-trivial case p=4. Our results show that at low temperature, successive layer-by-layer glass transitions cause the phase space of the model to form complex clusters. Just below the first glass transition temperature the first layer enters the full RSB phase, while deeper layers remain in the “liquid” phase. Then as one progressively lowers the temperature one observes that successive layers enter the 1-step RSB phase. Interestingly, the previous layers that were previously in the 1-RSB phase enter the 2-RSB phase, and so on. At very low temperatures the first layer is in a “full RSB + k-RSB” phase, a new hybrid phase that is not well understood and requires further research.

Simulation of contaminated air retention in a private dental treatment room using real data

Author: Eriko Nambu, Kazunori Nozaki 
Affiliation: Osaka University Dental Hospital

自然換気による歯科診療室内の換気効率の評価のため、CFDシミュレーションを行い空気齢を可視化することを目的として研究を行った。方法として、CADソフトにて製作した歯科診療室個室の三次元形状を元に、Star CCM+を用いて、歯科診療室内の自然換気および空調稼働時の気流を可視化した。その結果、自然換気のみの場合、気流から外れた箇所では空気齢の値が高くなったのに対し、空調や局所換気装置を稼働することによって室内全体の空気齢の値が低くなり、換気効率が向上することを明らかとした。

Numerical studies of mysteries in thermos-fluid physics

Author: Ken Naitoh 
Affiliation: Waseda University, Faculty of fundamental science and technology, Applied mechanics and aerospace engineering

スーパーコンピュータを利用して様々な問題の熱流体数値解析が
おこなわれているが、例えば、直管内で乱流遷移する位置と入口乱れ強さの関係を解明で
きる数値解析や理論は存在してこなかった。当方では、確率論的Navier-Stokes方程式とその境界条件の理論を新たに提案し、それに基づいて、現象の解明を可能にしてきている。
またそれを、高効率ロケットエンジン,レシプロエンジンの性能検討に利用することを進めてきている。

A Study for Accelerating Large Scale Neural Circuit Simulation on Multi-GPU Environment

Author: Yusuke Teranishi, Masao Okita, and Fumihiko Ino 
Affiliation: Graduate School of Information Science and Technology, Osaka University

本研究の目的は大規模なスパイキングニューラルネットワーク(SNN)シミュレーションの高速化である.マルチGPUを用いた大規模なSNNモデルの実行において,性能低下の主な要因となる通信処理を効率化し,総実行時間を削減する. 提案手法は神経回路の特性に着目し,即時に伝達する必要のない神経活動に関する通信を遅延させ,GPU上の計算とオーバラップする.通信の一部を計算処理で隠蔽することでシミュレーション性能の向上を目指す. マカク視覚野モデル(400万ニューロン)に提案手法を適用し,正しいシミュレーション結果を得られることを確認した.提案手法によって,通信におけるデータ転送の約99%を隠蔽できたが,当初期待していた性能向上は達成できなかった.この原因は,GPU間の計算負荷の不均一によって生じた通信の待ち時間を隠蔽できないためだと判明した.今後は負荷分散の改善に取り組み,本手法と組み合わせることで高速化を期待する.

Numerical Simulation of combustion phenomena inside engine cylinder

Author: Nobuyuki KAWAHARA 
Affiliation: Okayama University, Graduate School of Natural Science and Technology

目的 エンジンシリンダ内の燃焼現象(特に,化学反応)に関して,現象把握を目的に,乱流・化学反応動力学計算を実施した.
内容 エンジンシリンダ内の燃焼現象に関して,燃料/ガス噴射,火花点火,火炎伝ぱ,エンドガス部自着火,圧力波生成などの様子を圧縮性を考慮した3次元CFD技術により計算した.化学反応機構として
   素反応モデルを用い,一例として副室式ガスエンジンを対象とした.並列計算を実施するために,OCTOPUSを用いた
結果 一例として副室式ガスエンジンにおける燃料/中間生成物の生成・消費過程を解析した.

Numerical analysis of superconductivity based on Ginzburg-Landau equation and Eliashberg equation

Author: Hirono Kaneyasu 
Affiliation: Sanyo-Onoda City University

UTe2のゼロ磁場での超伝導状態とその安定化機構を調べるために、Eliashberg方程式の解析を行った。f,d軌道のオンサイトクーロン斥力が超伝導安定化に及ぼす効果を調べるため、摂動論による超伝導有効相互作用を用いてVertex補正を含めた解析を行った。この他に、不均一なchiral状態の磁場による履歴現象を調べるために、Ginzburg-Landau方程式の解析を行った。
WIEN2kの計算で得た電子状態を表すタイトバインディング模型について、f,d軌道にオンサイトクーロン斥力を設定する。オンサイト斥力に対する摂動から得られた3次までの超伝導有効相互作用を用いてEliashberg方程式を解析し、安定となる超伝導状態を調べた。Eliashberg方程式を超伝導転移温度において線形化した固有値方程式を数値的に解き、超伝導対称性における固有値の比較を行った。この他に、不均一超伝導のGinzburg-Landau方程式による数値解析を行い、chiral状態と超伝導電流の温度と磁場による変化を調べた。
解析から、ゼロ磁場の超伝導状態について、Vertex補正項の超伝導安定化に対する効果を示した。又、不均一なchiral状態の温度・磁場依存性から磁場による履歴現象を示した。

Development of a machine-learning force field for high-entropy alloy

Author: Tatsuhiko Ohto 
Affiliation: Graduate School of Engineering Science, Osaka University

9つの元素を含む高エントロピー合金の触媒活性を求めるための機械学習力場を構築した。密度汎関数法による分子動力学計算を行った上で、その結果をガウス過程回帰により学習させ、古典力場を生成した。その機械学習力場を用いた古典分子動力学計算から表面構造の候補をサンプルすることで、網羅的な触媒活性の評価を行った。

Structure search of silicene on the Ag(111) surface based on evolutionary algorithms and Gaussian process regression

Author: Yuji Hamamoto 
Affiliation: Department of Precision Engineering, Graduate School of Engineering, Osaka University

シリコンの二次元物質であるシリセンは特異な物性だけでなく次世代の半導体デバイス応用の観点から注目されてきた。シリセンはAg(111)表面上で非自明なバックル構造を示すためSTMやAFM、LEEDを用いた構造解析が行われてきたが、膨大な数の安定構造の候補が考えられるため理論的な解析は主に実験結果に基づくDFT計算に留まっていた。本研究では進化的アルゴリズムとガウス過程回帰に基づく構造探索アルゴリズムGOFEEを用いて網羅的かつ効率的にAg(111)表面上シリセンの安定構造を探索し、既知の安定構造に加えて未報告の安定構造が多数存在することを明らかにした。本研究の成果は機械学習による二次元物質の効率的な構造探索の道を切り開くという点で重要である。

Magnetohydrodynamic simulations of accretion of mass and magnetic fields onto a protostar

Author: Shinsuke Takasao 
Affiliation: Graduate School of Science, Osaka University

  Authors:Shinsuke Takasao Affiliation:Graduate School of Science, Osaka University Abstract:It is a project adopted for Research Proposal Based Use in FY 2022.  

Study on Fundamental Phenomena of Detonation and Its Application

Author: Nobuyuki Tsuboi 
Affiliation: Department of Mechanical and Control Engineering, Kyushu Institute of Technology

水素/空気予混合気に対する詳細化学反応モデルを使用して,3次元の非定常圧縮性粘性解析を行った.障害物を有する実スケールの閉鎖管(RUT形状)内を伝播する火炎から爆轟への遷移の数値解析を行い,デトネーションへの遷移における格子解像度の影響や2次元と3次元の差異を評価した.

Simulation studies by polymer physics model

Author: Katsumi Hagita 
Affiliation: Dept. of Appl. Phys., National Defense Academy

環状鎖が添加された高分子系の物性を詳しく評価するために、高分子物理モデルに基づく分子動力学(MD)シミュレーション研究を行った。GPUやCPUのHPC環境を効率よく活用する技術を確立するとともに、物性を調べる具体的なプロダクトランを行った。阪大のCPUとGPUの環境で、LAMMPS、HooMD-blueを相互利用し、Kremer-Grest模型のMD計算を効率よく実行するフレームワークを開発した。それらを活用し、高分子相分離構造、高分子結晶化、延伸破壊のMDシミュレーション評価手法などの種々の検討も合わせて行った。結果として、環状鎖を添加し高分子架橋ネットワークや関する系に関する論文を出版した。

Simulation of collisionless plasma shock

Author: 花野正浩¹, 坂和洋一², 佐野孝好² 
Affiliation: 大阪大学 大学院理学研究科¹, 大阪大学 レーザー科学研究所²

2次元粒子シミュレーションコードPICLSを用いて,高強度レーザー駆動プラズマイオン加速の物理機構を明らかにすることを目的とした.臨界密度程度のCHプラズマにパルス幅=27 fs, 規格化されたレーザー 強度= 30 の高強度レーザーを照射することにより,イオンを加速した.その結果,C6+イオンがMagnetic Vortex 加速を経てmagnetic pressure によって駆動された無衝突衝撃波加速にいたる,2段階加速をすることが明らかになった.

First principle studies on electrochemical CO2 reduction reactions

Author: Kazuhide Kamiya 
Affiliation: Research Center for Solar Energy Chemistry, Graduate School of Engineering, Osaka University.

電気化学CO2還元反応において、大気中から基質ガスに混入する可能性の高い酸素分子の触媒表面反応に対する影響を第一原理計算を用いて検討した。その結果、酸素還元中間体の吸着により、COの水素化反応の活性化エネルギーが変化することが明らかになった。

Study on two-phase flow in porous media using direct numerical simulation

Author: Yuto Takeuchi 
Affiliation: Graduate School of Agriculture, Kyoto University

直接数値計算により、流体パラメータと濡れ性による多孔質体中への流体の浸入様式の変化を調べることを目的として研究を行った。CUDAを用いて二相格子ボルツマン法を実装し、多孔質体内混相流シミュレーションを行った。Bo数、Ca数、接触角分布による流体浸入の変化を調べ、Boが小さいとフィンガー状に浸入しやすい、接触角が小さいとピストン状に浸入しやすい、接触角が小さい粒子からなる間隙を流路ととりやすいことが推察された。

3D Numerical Simulation of Droplet Impingement with Splash

Author: Tianyi Wei ,Ryoichi Kurose 
Affiliation: Kyoto University

Droplet impingement has long been a hot topic among researchers for its ubiquitousity in industrial applications. Effect on the outcome of the impingement pertaining to ambient gas pressure and surface wettability are focused on in this research. 3D detailed numerical simulations, with gas-liquid interface tracked by Coupled Level-set and Volume of Fluid (CLSVOF) method, are performed to explore the possibility of utilizing 3D numerical simulations for the investigation of droplet impingement on dry surfaces. Our research found that 3D numerical simulations can reproduce the phenomena related to droplet impingement including a splash. Wettability influences the outcome of droplet impingement at the initial stage (i.e., when the droplet initially touches down on the surface and generates a thin film from the three-phase contact line) by triggering a larger average velocity magnitude in the generated thin film, together with a stronger variation on the azimuthal velocity distribution generated by the impingement immediately after the touchdown onto the surface. Ambient pressure significantly prompts the splash during the spreading of droplets on the surface after the impingement. A vortex above the tip of the droplet is observed in the investigation. The generation and extension of filaments after the impingement, which is usually referred to as fingering for its shape, is significantly suppressed under high ambient pressure.

厚さの無い薄板を含んだ気液二相流計算手法の開発

Author: Takayuki Aoki 
Affiliation: Global Scientific Information and Computing Center, Tokyo Institute of Technology

空間を格子で離散化する数値流体シミュレーションにおいて、格子解像度を上げることは計算コストに4乗で影響する。有限な格子間隔よりずっと薄い暑さの物体を含んだ流れの計算に対し、局所的に細かい格子を割当てたとしても計算コストは膨大で計算は非効率的である。単相流体計算であれば、Direct Forcing 埋め込み境界法が適用できるが、有限体積法の気液二相流計算ではVOF値を保存させる必要があるため、厚さ無しの薄板として板の両側にそれぞれ別の格子(配列)を用意し、流体計算が薄板を超えて相互に参照しないようにする。さらに、FAVOR法を導入して直交格子の方向に沿わない薄板に対して計算を行えるようにし、薄板が計算Cellを非常に小さい体積に切断する場合、計算が不安定になることを避けるためにCell Merging法も導入した。これらにより、厚さ無しの薄板を含む気液二相流計算が可能になった。

Interaction between the Photo-excited π System and the f System in Rare-earth-based Macrocyclic Ligand Complexes

Author: Anas Santria 
Affiliation: Graduate School of Science, Osaka University

  Authors:Anas Santria Affiliation:Graduate School of Science, Osaka University Abstract:It is a project adopted for Research Proposal Based Use in FY 2022.  

Local environments of solute atoms in crystal structures

Author: Kazuki Shitara 
Affiliation: Japan Fine Ceramics Center

転位対構造中に溶質原子を加えた構造モデルの第一原理計算を行った.溶質のサイトとして転位付近のサイトを列挙し,モデル内で対称性的に独立な構造全てについて計算を実施した.格子歪に基づく弾性相互作用はCの方が大きいにも関わらず,OおよびNの転位との会合エネルギーはCと比較して大きく,弾性相互作用以外の電気的な転位-溶質間相互作用力が働いていることを示した.

Transport of fast-electrons produced by intense laser-plasma interactions with PHITS code

Author: Shinsuke FUJIOKA¹, Ryunosuke TAKIZAWA², Tamaki MAEGAWA³, Takumi TSUIDO⁴, King Fai Farley LAW⁵ 
Affiliation: Institute of Laser Engineering, Osaka University¹, Dept. Phys., Graduate School of Science, Osaka University²-⁵

(Objective) Interaction between high-intensity laser light and matter produces high-energy or fast
electrons. In laser-driven inertial confinement fusion, the energy distribution of the fast electrons
is one of the critical parameters that determine the heating efficiency of fusion fuel. However, it
is hard to measure directly because an electric field around a plasma confines a significant portion
of the fast electron in the plasma. In this study, we develop a method to estimate the energy
distribution of the fast electrons from the spectrum of X-rays emitted by them traveling in a
plasma.
(Description) The process of bremsstrahlung X-ray emission by fast electrons with multiple quasimonoenergetic
energies in the matter is calculated using the Monte Carlo simulation code PHITS
for radiation generation and transport installed in OCTOPUS. The energy distribution of fast
electrons was obtained by reconstructing the experimentally observed X-ray spectrum with the
linear sum of the above Bremsstrahlung X-ray spectra.
(Results) The energy distribution of electrons was successfully estimated from the X-ray spectrum
obtained in the experiment. From the energy distribution, it was directly observed that the fast
electrons were trapped by the electromagnetic field formed around the target.

Weight Estimation of Unknown Shape Construction and Demolition Waste Composed of Single Material Using Point Cloud Classification by Deep Learning

Author: Hiroto Shimizu 
Affiliation: Environmental Design and Information Technology Subarea (Yabuki Laboratory), Sustainable Environmental Design Area, Course of Environmental Engineering, Division of Sustainable Energy and Environmental Engineering, Graduate School of Engineering, Osaka University (Japan)

建造物の解体時や建築施工時に発生する廃材のうち再利用可能な廃材を現場で分類する必要があるが,人件費や安全性の観点から分類作業を自動化することが対策として挙げられ,自動機器開発の研究が行われている.しかし耐荷重量の限界まで持ち運びが可能となり,建造物の解体撤去作業等の時短につながる重量推定の機能は実装されていない.本研究では点群と3D instance segmentationを使用して単一材料で構成された廃材に対して自動分類と未知形状にも適用可能な重量推定の双方を可能にした.検証に使用した27個の廃材のうち19個ほど形状・種類を自動分類し,重量の実測値に対する割合誤差が12.9 %±6.5 %の精度で推定された.

Co-solvation free energy analysis of insulin dissociation focusing on the structure of medicinal small molecules

Author: Shimon Hikiri 
Affiliation: Graduate School of Engineering Science, Osaka University

  Authors:Shimon Hikiri Affiliation:Graduate School of Engineering Science, Osaka University Abstract:It is a project adopted for Research Proposal Based Use in FY 2022.